福建地方鴨品種微衛(wèi)星位點的篩選和多態(tài)性分析.pdf

1、微衛(wèi)星標記屬于共顯性的遺傳標記，具有高度的多態(tài)性，是中性遺傳的，所以在目前被認為是最好的用于群體基因研究的孟德爾分子標記。本文利用微衛(wèi)星標記，旨在通過構建鴨微衛(wèi)星富集文庫克隆一些微衛(wèi)星DNA序列，利用克隆的序列設計引物，并通過PCR擴增及其擴增片段大小的分析，來檢測5個福建地方鴨品種的基因型，分析了等位基因頻率、多態(tài)信息含量、雜合度、有效等位基因數(shù)、遺傳距離和聚類結果，并探討了各品種內(nèi)的遺傳變異和品種間的遺傳關系。 本研究應用磁

2、珠富集法構建了(GA)n、(CT)n、(CA)n、(TG)n重復類型的鴨混合型微衛(wèi)星富集文庫。挑選46個陽性克隆測序獲得到14含有微衛(wèi)星的DNA序列，并設計14對微衛(wèi)星引物遞交到了GenBank(GenBank登錄號：FJ599499-FJ599512)。通過PCR優(yōu)化從中獲得5個具有中度或高度多態(tài)性的基因座，然后用這5個基因座對5個福建地方鴨品種作遺傳多樣性分析。 群體遺傳結構的微衛(wèi)星分析表明：①5個鴨品種在5個微衛(wèi)星基因座中

3、共檢測到31個等位基因，平均每個基因座有6.2個等位基因。②5個微衛(wèi)星基因座在5個鴨品種中的平均多態(tài)信息含量為0.5133，其中微衛(wèi)星FJAU011的多態(tài)信息含量最高(0.5860)。各位點的有效等位基因數(shù)在2.1652-3.9904之間。5個鴨品種的平均雜合度為0.7480，5個群體的基因雜合度變化范圍在0.5115-0.7000之間。③哈代-溫伯平衡檢驗結果表明，只有少數(shù)品種的少數(shù)位點處于平衡狀態(tài)，大多數(shù)位點都處于不平衡狀態(tài)。④F-