睢寧白山羊和其他幾種山羊的遺傳多樣性分析及GDF9基因與山羊繁殖性能的相關性研究.pdf

1、本研究采用9個微衛(wèi)星標記對睢寧白山羊及我國其他7個地方山羊品種群體進行遺傳多樣性分析,并以睢寧白山羊為主要研究對象,以GDF9基因作為候選基因,檢測了該基因在睢寧白山羊群體中的多態(tài)情況,分析了其與山羊繁殖性能(產羔數、窩產羔重)的相關關系。結果如下:
　　 1.9個微衛(wèi)星位點在8個山羊品種中共檢測到了143個等位基因,平均每個位點達15.9個。X2檢驗表明:除了長江三角洲白山羊在BMS1724和MB067位點上處于Hardy-W

2、einberg平衡,其余各位點的品種群體均處于遺傳不平衡狀態(tài)。
　　 2.9個微衛(wèi)星位點均為高度多態(tài)位點,其雜合度在0.6674-0.8928之間,多態(tài)信息含量在0.7128-0.8338之間;睢寧白山羊的平均雜合度和多態(tài)信息含量分別為0.7861和0.7557。
　　 3.在這9個微衛(wèi)星位點中,MAF70位點的基因分化系數(GST值)最大,為0.2098;BMS1248位點上的GST值最小,為0.0699。群體總GST

3、值為0.1062,說明有10.62％的遺傳多樣性是分布于群體間的,其余89.38％則分布于群體內。
　　 4.根據遺傳距離Ds和DA分別進行系統(tǒng)發(fā)生樹的UPGMA法聚類和N-J法聚類。相對而言,根據DA遺傳距離以UPGMA方法構建的系統(tǒng)發(fā)生樹較為合理可靠,睢寧白山羊與黃淮山羊首先聚為一類,長江三角洲白山羊與宜昌白山羊依次加入,馬頭山羊與湘東黑山羊聚為一類加入,最后福清山羊與戴云山羊單獨聚為一類。
　　 5.對GDF9基因

4、全部5'端側翼區(qū)及第一、第二外顯子區(qū)的序列進行SSCP分析,結果表明:引物P1、P4、Ex1-2擴增產物各檢測出3種基因型,引物P8和Ex2-3擴增產物各檢測出2種基因型;引物Ex2-4擴增產物檢測出6種基因型。測序表明:5'端側翼區(qū)的-1569bp處發(fā)生G→C的突變,-1054 bp處發(fā)生G→A的突變,-34bp處發(fā)生T→C的突變;外顯子1的+183 bp處發(fā)生C→A的突變,未導致氨基酸改變;外顯子2的+1943bp處發(fā)現C→T的突變

5、,導致Ala→Val;+2314bp、+2315bp處均發(fā)生G→A的突變,前者為沉默突變,后者導致Val→Ile。
　　 6.群體遺傳特性分析表明:引物P8和引物Ex2-3擴增產物上檢測到的多態(tài)為低度多態(tài)位點,遺傳變異較小;其余檢測到的均為中度多態(tài)位點。X2檢驗表明,所有突變位點均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。
　　 7.對不同基因型與睢寧白山羊的頭胎產羔數及窩產羔重進行最小二乘分析。引物P1和P4所擴增片段

6、不同基因型間頭胎產羔數及窩產羔重的最小二乘均值差異不顯著(P＞0.05)。引物Exl-2擴增片段中GG基因型與HH基因型間頭胎產羔數差異顯著(P＜0.05),GH基因型與GG、HH基因型問差異均不顯著(P＞0.05);該片段各基因型間窩產羔重差異不顯著(P＞0.05)。引物Ex2-4擴增的片段中MM基因型頭胎產羔數與KL、LL基因型差異顯著(P＜0.05),其余各組差異不顯著(P＞0.05);MM基因型頭胎窩產羔重KK、KL、LL基因型