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文檔簡(jiǎn)介
1、生長(zhǎng)分化因子9(growth differentiation factor9, GDF9)和骨形態(tài)發(fā)生蛋白15(bone morphogenetic protein15, BMP15)基因是轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)分化因子β(transformi-ng growth factorβ, TGFβ)超家族的成員,對(duì)早期卵泡的生長(zhǎng)和分化起到重要的調(diào)節(jié)作用。對(duì)貴州白山羊 GDF9和BMP15基因成熟肽序列的分析表明,GDF9基因外顯子2編碼區(qū)1007位、790
2、位和BMP15基因外顯子2編碼區(qū)的571位、673位和796位出現(xiàn)了堿基替換,并導(dǎo)致編碼的氨基酸發(fā)生了改變,為了進(jìn)一步探索這5個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)與貴州白山羊繁殖力之間的關(guān)系,采用等位基因特異 PCR(AS-PCR)的方法對(duì)5個(gè)位點(diǎn)氨基酸密碼子所在的區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增,克隆、測(cè)序和基因型分析,獲得的主要結(jié)果如下:
1、GDF9基因外顯子2編碼區(qū)1007位(C→T)和790位(C→A)分別使成熟肽第18位氨基酸由丙氨酸替換為纈氨酸,成熟肽第7
3、8位氨基酸由脯氨酸轉(zhuǎn)變谷氨酰胺,在貴州白山羊高產(chǎn)和低產(chǎn)羊群中進(jìn)行多態(tài)性檢測(cè),結(jié)果表明:1007位點(diǎn)在高產(chǎn)羊群中90%為雜合型,低產(chǎn)羊群中全部為雜合型,沒(méi)有檢測(cè)到突變型,基因型頻率在兩種羊群之間的差異不顯著(P>0.05),而C1007T氨基酸之間的替換為非極性氨基酸之間的替換,且該位點(diǎn)不處于GDF9蛋白的關(guān)鍵位置,所以堿基多態(tài)性變化對(duì)蛋白功能影響不大,因此1007位點(diǎn)的多態(tài)性與貴州白山羊的繁殖力沒(méi)有直接的相關(guān)性。第790位點(diǎn)中共檢測(cè)到
4、AA和AB兩種基因型,頻率分別為:高產(chǎn)羊群0.1和0.9;低產(chǎn)羊群0.17和0.83,A等位基因的頻率高于B等位基因的頻率,其產(chǎn)羔數(shù)為AB>AA基因型,兩種基因型之間的差異性顯著(0.01
5、07位的多態(tài)性與790位點(diǎn)的多態(tài)性不存在相關(guān)性(R=0.1256,P>0.05)。
2、BMP15基因外顯子2編碼區(qū)571位(A→G)、673位(A→C)和796位(G→A)分別使編碼的成熟肽32位氨基酸由絲氨酸轉(zhuǎn)變?yōu)楦拾彼幔怀墒祀?6位由天冬酰胺/組氨酸;成熟肽107位由甘氨酸/精氨酸。多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果表明:673位點(diǎn)在所檢測(cè)的貴州白山羊中只檢測(cè)到野生的AA基因型,沒(méi)有發(fā)現(xiàn)多態(tài)性,該位點(diǎn)位于BMP15結(jié)構(gòu)的手掌內(nèi)側(cè),其變化不足
6、以影響結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性,因此與貴州白山羊的繁殖力無(wú)關(guān)。571位點(diǎn)在高產(chǎn)羊群中檢測(cè)到AA、AB和BB基因型,低產(chǎn)羊群中只檢測(cè)到AA和AB基因型,796位點(diǎn)在高產(chǎn)羊群和低產(chǎn)羊中都檢測(cè)到AA、AB和BB三種基因型,對(duì)其進(jìn)行的各種基因型與產(chǎn)羔數(shù)的差異性分析發(fā)現(xiàn),571位點(diǎn)和796位點(diǎn)的產(chǎn)羔數(shù)依次為AA
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