小黃魚五個地理群體形態(tài)變異和遺傳多樣性研究.pdf

1、小黃魚（Larimichthys polyactis）是中國沿海重要的經(jīng)濟(jì)魚類，但由于過度捕撈和環(huán)境惡化等因素的影響，其產(chǎn)量逐年減少;雖自上世紀(jì)80年代實施伏季休漁制度以來，小黃魚資源量有一定程度回升，但仍未恢復(fù)至良好狀態(tài)。本文以采自中國沿海的五個小黃魚地理群體——福建沙埕(Sha Cheng，SC)群體、浙江臺州群體(Tai Zhou，TZ、江蘇連云港群體(Lian Yun Gang，LYG)、山東煙臺群體(Yan Tai，YT)以及

2、遼寧東港群體(Dong Gang，DG)為研究對象，基于形態(tài)框架數(shù)據(jù)、線粒體細(xì)胞色素b基因(Cytochromeb，Cytb)全序列和控制區(qū)(D-loop)全序列，對其群體形態(tài)變異和遺傳多樣性進(jìn)行研究，以期為小黃魚種質(zhì)資源有效管理和可持續(xù)開發(fā)利用提供基礎(chǔ)理論依據(jù)。
　　 主要研究結(jié)果如下:
　　 一、測量小黃魚五個地理群體共186個個體的形態(tài)框架性狀，每個個體測量其體長及18個框架數(shù)據(jù)，經(jīng)去除極值后，取185個有效個體框

3、架數(shù)據(jù)進(jìn)行形態(tài)變異分析。聚類和判別分析的結(jié)果表明:SC、YT、DG和TZ群體依次聚類在一起，最后和連云港群體(LYG)相聚。判別分析結(jié)果顯示群體綜合判別準(zhǔn)確率達(dá)98.9％。
　　 二、測定小黃魚五個地理群體共114個個體的線粒體細(xì)胞色素b(Cytb)基因全序列（全長1141bp，均無插入/缺失），共檢測到94個單倍型，祖先單倍型為hap39，單倍型多樣性指數(shù)(Hd=0.992)和核苷酸多樣性指數(shù)（π=0.45％）表明小黃魚5個地

4、理群體具有較高的單倍型多樣性和較低的核苷酸多樣性。利用K-2-P模型（Kimura-2-parameter）計算的小黃魚五個地理群體內(nèi)與群體間的遺傳距離分別為0.375％～0.574％和0.386％～0.540％，表明群體內(nèi)與群體間差異很小;利用單倍型構(gòu)建的鄰接樹（Neighbor-joining tree）和單倍型網(wǎng)絡(luò)圖(network)表明五個群體間的個體分布無明顯的聚集性;五個群體間遺傳分化指數(shù)（Fst）在0.00019～0.02

5、474之間，表明小黃魚地理群體間遺傳分化均很小;分子方差分析(AMOVA)的結(jié)果顯示，群體間遺傳差異不顯著，群體的變異主要集中在群體內(nèi)部。Tajima'D和Fu's Fs的中性檢驗表明五個地理群體均顯著偏離中性，提示可能經(jīng)歷過群體擴(kuò)張或瓶頸。
　　 三、測定小黃魚五個地理群體共115個個體線粒體控制區(qū)(D-loop)全序列（全長796～798bp，其中DG群體有2個堿基插入/缺失，TZ群體有1個堿基的插入/缺失），共定義單倍型1

6、07個，主體單倍型為H33;單倍型多樣性指數(shù)(Hd=0.998)和核苷酸多樣性指數(shù)（π=1.075％）顯示小黃魚五個地理群體具有較高的單倍型多樣性和偏低的核苷酸多樣性;利用K-2-P模型(Kimura-2-parameter)計算的小黃魚五個地理群體內(nèi)與群體間的遺傳距離分別為0.927％～1.359％和0.993％～1.227％，表明群體內(nèi)與群體間差異均很小;利用單倍型構(gòu)建的鄰接樹（Neighbor-joining tree）和單倍型網(wǎng)