中國(guó)沿海5個(gè)地理群體長(zhǎng)蛸的遺傳多樣性研究.pdf_第1頁(yè)
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1、上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文中國(guó)沿海5個(gè)地理群體長(zhǎng)蛸的遺傳多樣性研究姓名:孫寶超申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專(zhuān)業(yè):水產(chǎn)養(yǎng)殖指導(dǎo)教師:楊建敏孫國(guó)華20090510上海海洋大學(xué)碩學(xué)位論文蛸屬的長(zhǎng)蛸則較遠(yuǎn)。采用AFLP分子遺傳標(biāo)記技術(shù),對(duì)中國(guó)沿海大連、煙臺(tái)、青島、連云港、舟山5個(gè)地理群體長(zhǎng)蛸的遺傳多樣性進(jìn)行研究。采用4對(duì)AFLP引物組合對(duì)5個(gè)群體的150個(gè)個(gè)體進(jìn)行擴(kuò)增,共得到190個(gè)的位點(diǎn),5個(gè)群體內(nèi)的多態(tài)位點(diǎn)比例為6429%8913%,總多態(tài)位點(diǎn)比例為7

2、316%。群體的Nei’S基因多樣性指數(shù)(H)為0088501272,Shannon多樣性指數(shù)為0129301890,群體間的遺傳距離為0030400842,遺傳分化系數(shù)(Fst)值為018360;根據(jù)5個(gè)群體之間的遺傳距離(D)、遺傳相似度(S)以及用NJ和UPGMA法聚類(lèi)分析發(fā)現(xiàn),LY和ZS親緣關(guān)最近,DL和LY親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。聚類(lèi)結(jié)果顯示,5個(gè)群體分成兩個(gè)分支,DL群體和YT群體聚在一起,成為一個(gè)分支。LY群體和ZS群體聚在一起,然

3、后與QD群體聚在一起,形成另一支;分子變異(AMOVA)分析表明,長(zhǎng)蛸群體遺傳變異主要來(lái)源于群體內(nèi)。關(guān)鍵詞:長(zhǎng)蛸,PCR,COI,16SrRNA,AFLP,遺傳多樣性TheGeneticStructureandDiversityAnalysisinFivePopulationsofOctopusvariabilisinChinaABSTRACTOctopusvariabilisSasaki,1929(Cephalopoda,Octopo

4、da,Octopodidae,Octopus)distributealongthecoastofourcountryattheBohaiSeaYellowSeaandEastChinaSea,theSouthChinaSea;theNorthKorea’SwestcoastandthewesternPacificwatersofthedistributionoftheJapanesearchipelagoInChina,Ovariabi

5、lismainlydistributedinthenortherncoastalwatersDvariabilisnotonlyhavehighproteincontent,butalsohaveconsiderablemedicinalvalue,isimportanteconomiccephalopodsMitochondrialcytochromecoxidasesubunitIgene(COI)and16SrRNAgenefra

6、gmentsof0variabilisandCindicuswereamplifiedusingPCR,thePCRproductswerepurifiedandsequenced554bpand658bpnucleotidesequencesofpartialCOIgeneandpartial16SrRNAgenealeobtainedrespectivelyinOvariabilisThecontentofA,T,GandCinth

7、efragmentwere381%,356%,83%,181%and369%,302%,185%,143%514bpand665bpnucleotidesequencesofpartialCOIgeneandpartiM16SrRNAgeneareobtainedrespectivelyinCindicusThecontentofA,T,GandCinthefragmentwere375%,35O%,91%,183%and301%,35

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