中華鱉兩個(gè)地理群體遺傳多樣性的ISSR分析.pdf

1、中華鱉(Pelodiscus sinensis)是我國(guó)重要名特優(yōu)水產(chǎn)，具有較高的食用和藥用價(jià)值。了解中華鱉的遺傳多樣性水平、遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳分化程度，對(duì)其種質(zhì)資源評(píng)價(jià)、保護(hù)和合理利用具有著重要理論指導(dǎo)意義。本文利用ISSR（簡(jiǎn)單序列重復(fù)區(qū)間擴(kuò)增多態(tài)性，inter-simple sequence repeat）分子標(biāo)記技術(shù)，對(duì)中華鱉淮河群體和臺(tái)灣群體的遺傳多樣性進(jìn)行分析，主要結(jié)果如下：
　　 1.利用正交試驗(yàn)方法，經(jīng)優(yōu)化，建立了中華

2、鱉ISSR-PCR最佳反應(yīng)體系，即25μL反應(yīng)體系中含0.4μmol/LISSR引物、30ng模板、2.5mmol/LMg2+、0.2mmol/LdNTPs和0.2UTaq酶。確立了PCR的最佳擴(kuò)增程序，每個(gè)循環(huán)包括：94℃變性40s；（52-58℃）退火45s，72℃延伸60s；一共循環(huán)40次，首次循環(huán)前先94℃預(yù)變性5min，最后一次循環(huán)結(jié)束后72℃延伸10min。
　　 2.篩選出8個(gè)ISSR引物，對(duì)2個(gè)地理群體共37個(gè)中

3、華鱉的基因組DNA進(jìn)行ISSR-PCR擴(kuò)增，共檢測(cè)到77個(gè)位點(diǎn)，多態(tài)位點(diǎn)47個(gè)，多態(tài)性比例為61.04％。經(jīng)POPGENE 軟件分析淮河群體和臺(tái)灣群體多態(tài)位點(diǎn)比例分別為59.57％和51.06％；有效等位基因分別為1.5603和1.5222；Nei的基因多樣性分別為0.1657和0.1524；Shannon信息指數(shù)分別為0.2164和0.1977。結(jié)果表明2個(gè)中華鱉群體的遺傳多樣性較為貧乏，淮河群體遺傳多樣性水平略高于臺(tái)灣群體。

4、　　 3.基于Nei的基因多樣性計(jì)算出中華鱉兩群體間的遺傳分化系數(shù)Gst為0.0796，說明兩群體存在中等的遺傳分化。由Gst計(jì)算的種群間基因流Nm為5.7778，兩群體的基因交流水平較高。根據(jù)Nei的公式計(jì)算群體間的無偏遺傳距離(D)，中華鱉兩群體間遺傳距離為0.0837，小于0.2，說明兩個(gè)群體遺傳分化水平已處于地理群體分化水平，UPGMA聚類分析顯示37個(gè)個(gè)體聚成兩個(gè)類群，表明2個(gè)養(yǎng)殖群體經(jīng)過較多世代的人工選育與繁殖可能形成了趨