趨化因子受體CXCR1基因多態(tài)性與奶牛乳腺炎的關(guān)聯(lián)性分析.pdf_第1頁(yè)
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1、趨化因子是能使細(xì)胞發(fā)生趨化運(yùn)動(dòng)的小分子細(xì)胞因子,趨化因子白介素-8被驗(yàn)證具有誘導(dǎo)中性粒細(xì)胞遷移等能力,其兩受體α(IL8R-α,即CXCR1)和β(IL8R-β,即CXCR2)通過(guò)與趨化因子相結(jié)合并借助信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)來(lái)實(shí)現(xiàn)介導(dǎo)中性粒細(xì)胞和淋巴細(xì)胞在炎癥部位聚集,修復(fù)組織損傷等功能,目前兩基因已被列入抗乳腺炎的候選基因。
   本研究通過(guò)采用DNA測(cè)序、巢氏PCR和CRS-PCR方法,對(duì)中國(guó)荷斯坦牛、魯西黃牛、渤海黑牛的趨化因子受體基因

2、CXCR1的單核苷酸多態(tài)性(SNPs)進(jìn)行研究,結(jié)果在CXCR1基因第二外顯子發(fā)現(xiàn)了4個(gè)SNPs,分別為291(C/T)、333(C/T)、337(A/G)和365(C/T),其中337(A/G)位點(diǎn)和365(C/T)位點(diǎn)的堿基突變引起相應(yīng)位置氨基酸發(fā)生改變.337(A/G)位點(diǎn)突變引起異亮氨酸轉(zhuǎn)變?yōu)槔i氨酸,365(C/T)位點(diǎn)突變引發(fā)丙氨酸轉(zhuǎn)變?yōu)槔i氨酸。
   群體遺傳多態(tài)性檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn),291(C/T)、333(C/T)、337

3、(A/G)和365(C/T)位點(diǎn)在中國(guó)荷斯坦牛、魯西黃牛、渤海黑牛群體均達(dá)到中度多態(tài)(0.25<PIC<0.5),群體遺傳多態(tài)信息含量分布較為平均,4突變位點(diǎn)優(yōu)勢(shì)等位基因分別為C、C、A、C,等位基因頻率分別為0.82/0.67/0.65、0.80/0.74/0.71、0.63/0.76/0.63、0.70/0.65/0.82、0.56/0.58/0.56。經(jīng)x2適合性檢驗(yàn).渤海黑牛所有位點(diǎn)全部達(dá)到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(

4、P>0.05);荷新坦牛在突變位點(diǎn)291(C/T)、333(C/T)和337(A/G)達(dá)到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05):魯西黃牛僅在365(C/T)位點(diǎn)達(dá)到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05),說(shuō)明該位點(diǎn)較受外界引種和突變等影響,群體尚待進(jìn)一步穩(wěn)定。
   研究中國(guó)荷斯坦奶牛CXCR1基因多態(tài)性(SNP)與奶牛乳腺炎性狀的關(guān)聯(lián)性,使用Phase軟件進(jìn)行單倍型組合預(yù)測(cè),構(gòu)建出15種單倍型和2

5、0種單倍型組合。通過(guò)單位點(diǎn)基因型與乳腺性狀關(guān)聯(lián)性分析發(fā)現(xiàn),291(C/T)和333(C/T)突變不存在顯著相關(guān)的平均值;337(A/G)突變位點(diǎn)基因型個(gè)體在乳脂率、乳蛋白率及產(chǎn)奶量分析上存在顯著相關(guān)(P<0.05)的平均值;365(C/T)突變位點(diǎn)基因型個(gè)體在乳脂率分析上存在顯著相關(guān)(P<0.05)的平均值。通過(guò)單倍型組合與乳腺炎的關(guān)聯(lián)性分析發(fā)現(xiàn)在體細(xì)胞評(píng)分、305天產(chǎn)奶量、乳蛋白率、乳脂量和乳蛋白量5項(xiàng)測(cè)試指標(biāo)中,基因型組合個(gè)體之間均

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