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文檔簡介
1、羊鮑有較高的營養(yǎng)和藥用價值,含多種維生素和微量元素。由于海區(qū)污染和過度捕撈,導(dǎo)致羊鮑資源受到嚴(yán)重破壞。本研究采用磁珠富集法,開發(fā)了9對羊鮑高多態(tài)微衛(wèi)星引物,并應(yīng)用微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)對海南3個羊鮑群體進行遺傳多樣性和遺傳分化研究,且分析了羊鮑和耳鮑線粒體Cytb基因片段序列的差異。以期為羊鮑種質(zhì)資源的良種選育、可持續(xù)利用和保護提供科學(xué)依據(jù)。
采用磁珠富集法,利用生物素標(biāo)記的(GT)15、(CT)15混合寡核苷酸探針從羊鮑的基因組
2、DNA的MboI酶切片段中篩選300~900bp的微衛(wèi)星序列。將洗脫的雜交片段克隆到pMD19-T載體上構(gòu)建富集微衛(wèi)星基因組文庫,通過PCR篩選檢測出陽性克隆進行測序。挑取576個克隆檢測,取150個片段大小為500~1000bp克隆測序,從中設(shè)計了40對引物。以海南英州群體為研究對象,對引物進行多態(tài)性檢測,共檢測出12對多態(tài)引物,其等位基因數(shù)為2~5個,多態(tài)信息含量為0.153~0.637,觀察雜合度為0.0000~0.7857,期望
3、雜合度為0.0734~0.6019。多態(tài)性分析結(jié)果顯示,9對引物均具有較高的多態(tài)性,適合進行群體遺傳學(xué)研究。
利用本實驗所篩選的9對微衛(wèi)星引物,對我國海南3個羊鮑野生群體的遺傳結(jié)構(gòu)進行研究,分析了各群體內(nèi)的遺傳多樣性和3個群體間的遺傳分化。羊鮑3個群體平均每位點等位基因數(shù)(A)介于2.7778~3.5556之間,平均為3.2593;平均每位點有效等位基因數(shù)(Ae)介于1.8662~2.0512之間,平均為1.9322;多態(tài)信息
4、含量(PIC)介于0.4596~0.5434之間,平均為0.4978;觀察雜合度在0.3650~0.4259之間,平均為0.3964;期望雜合度在0.4274~0.4779之間,平均為0.4480。群體間遺傳距離(D)介于0.0174~0.0256之間,遺傳分化系數(shù)(Fst)為0.0178,3個羊鮑群體間遺傳分化較小。微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)分析結(jié)果認為,我國海南羊鮑群體遺傳多樣性處于較低水平,野生羊鮑資源受到破壞,應(yīng)及時采取有效的保護措施,
5、以期為羊鮑種質(zhì)資源鑒定和保護和可持續(xù)發(fā)展提供科學(xué)依據(jù)。聚類分析顯示,英州群體與亞龍灣群體先聚為一類,再與安游群體聚為一類。
通過PCR擴增、測序羊鮑和耳鮑的線粒體Cytb基因片段序列。結(jié)果表明,羊鮑3個群體間的Cytb片段堿基組成含量較為相似,A+T含量(平均為58.9%)也較為相似,高于G+C含量。羊鮑和耳鮑間堿基組成也較為相似。羊鮑3個群體間的遺傳距離為0.007~0.019。羊鮑與耳鮑間的遺傳距離為0.113。聚類分析顯
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