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文檔簡介
1、中國是世界上少數(shù)幾個(gè)雙峰駝資源豐富的國家之一,雙峰駝在歷史上對我國文化交流、經(jīng)濟(jì)發(fā)展、荒漠和半荒漠地區(qū)畜牧業(yè)發(fā)展等方面都發(fā)揮了重要作用。但目前對我國雙峰駝資源的遺傳多樣性和起源馴化研究還不夠系統(tǒng)和全面。
本文利用基因組微衛(wèi)星標(biāo)記、線粒體D-loop部分序列從核基因組、母系起源兩個(gè)方面分析我國9個(gè)雙峰駝群體和1個(gè)蒙古雙峰駝群體遺傳多樣性和起源馴化,同時(shí),本文首次在駱駝mtDNAD-loop區(qū)發(fā)現(xiàn)長度異質(zhì)性現(xiàn)象,并對其進(jìn)行了檢
2、測和分析,結(jié)果如下:
1、用FAO推薦的18對微衛(wèi)星引物對9個(gè)中國雙峰駝群體和1個(gè)蒙古雙峰駝群體,共452份樣品進(jìn)行遺傳多樣性及群體遺傳關(guān)系分析,結(jié)果顯示:10個(gè)雙峰駝群體具有豐富的遺傳多樣性,平均有效等位基因?yàn)?.18,共檢測到242個(gè)等位基因,平均每個(gè)位點(diǎn)檢測到13.44個(gè);平均觀察雜合度為(Ho)0.5528,平均多態(tài)信息含量(PIC)為0.5996。
2、遺傳分化分析表明10個(gè)雙峰駝群體間存在極顯著的
3、遺傳分化,有9.6%的遺傳變異來自群體間,90.4%遺傳變異來自群體內(nèi)部的個(gè)體間。聚類分析表明10個(gè)雙峰駝群體被分成2個(gè)明顯的分支,與地理分布基本一致。
3、測定了10個(gè)雙峰駝群體的205個(gè)線粒體D-loop區(qū)940bp長序列,共發(fā)現(xiàn)17個(gè)多態(tài)位點(diǎn),與其他畜種相比,雙峰駝D-loop區(qū)序列表現(xiàn)出相對的保守性,定義了21個(gè)單倍型。系統(tǒng)進(jìn)化和網(wǎng)絡(luò)中介分析表明,家養(yǎng)雙峰駝群體都來自一個(gè)支系,并且該支系存在3個(gè)優(yōu)勢單倍型,包含個(gè)體
4、占全部個(gè)體的80%以上,加入GenBank下載的86條序列,得到了同樣的單倍型、系統(tǒng)進(jìn)化以及網(wǎng)絡(luò)中介分析結(jié)果。
4、首次在雙峰駝線粒體D-loop區(qū)發(fā)現(xiàn)線粒體DNA異質(zhì)性現(xiàn)象,對PCR擴(kuò)增的假陽性結(jié)果進(jìn)行了排除,對同一個(gè)體的異質(zhì)性片段進(jìn)行克隆測序,分析異質(zhì)性特點(diǎn)和種類,初步排除了是源于線粒體假基因的可能性,對6個(gè)雙峰駝群體進(jìn)行異質(zhì)性檢測,發(fā)現(xiàn)99.2%的個(gè)體存在異質(zhì)性現(xiàn)象,以異質(zhì)性片段作為一個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)進(jìn)行分析,聚類分析表
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