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文檔簡介
1、方氏云鳚(Pholis fangi)與云鳚(Pholis nebulosa)同屬于鱸形目(Perciformes)、鳚亞目(Blennoidei)、錦鳚科(Pholidae)、云鳚屬(Pholis),為冷溫性底層魚類,方氏云鳚主要分布于黃、渤海,云鳚在黃、渤海以及東海均有分布。本研究綜合運用傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)標(biāo)記以及線粒體DNA分子標(biāo)記,研究了方氏云鳚和云鳚的群體遺傳結(jié)構(gòu)、歷史動態(tài)以及遺傳多樣性現(xiàn)狀,并對方氏云鳚與云鳚種間差異進(jìn)行了探討。
2、> 利用傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)方法,對4個不同地理群體方氏云鳚的10個可數(shù)性狀和13個可量性狀進(jìn)行了比較研究。分節(jié)特征方面與以往的分類學(xué)資料相一致,方氏云鳚群體的各分節(jié)性狀值分布范圍大致相當(dāng),難以作為劃分不同群體的依據(jù);對量度特征的主成分分析、判別分析、單因子方差分析等結(jié)果顯示各群體間存在顯著差異。
為研究方氏云鳚的群體遺傳多樣性水平、遺傳結(jié)構(gòu)現(xiàn)狀及其群體動態(tài)歷史,擴(kuò)增并分析了9個地理群體的方氏云鳚控制區(qū)片段序列、COI序列和Cyt b
3、序列。在控制區(qū)片段分析中,共檢測181個個體,得到25個單倍型,表現(xiàn)出中等程度的單倍型多樣性和偏低的核苷酸多樣度。分子方差分析(AMOVA)和兩兩群體相比較的FST結(jié)果顯示方氏云鳚在所研究范圍內(nèi)不存在顯著的遺傳結(jié)構(gòu)。中性檢驗和核苷酸不配對分布分析的結(jié)果表明方氏云鳚在晚更新世時經(jīng)歷過群體擴(kuò)張事件。在COI序列和Cyt b序列分析中,得到了與控制區(qū)片段分析相類似的實驗結(jié)果。同時,我們擴(kuò)增了方氏云鳚的線粒體控制區(qū)全序列(853bp),對照其他
4、已報道的魚類控制區(qū)結(jié)構(gòu),分析了方氏云鳚的線粒體控制區(qū)結(jié)構(gòu)。識別出了終止序列區(qū)、中央保守區(qū)和保守序列區(qū),并找到與終止命令相關(guān)的TAS序列以及保守序列(CSB-F、CSB-E、CSB-D、CSB-C、CSB-B、CSB-A、CSB-1、CSB-2、CSB-3)。
采用多元數(shù)理統(tǒng)計分析方法探討了采自分別長海和俚島的2個云鳚群體間的形態(tài)差異。結(jié)果顯示,不同群體的分節(jié)特征分布范圍大致相當(dāng),分節(jié)特征難以作為云鳚群體劃分的指標(biāo)。而不同群體間
5、在可量性狀上存在一定程度的分化。
采用線粒體DNA控制區(qū)部分序列對云鳚群體遺傳結(jié)構(gòu)和群體動態(tài)歷史進(jìn)行了研究,在云鳚群體內(nèi)檢測到了兩個單倍型類群的存在,更新世冰期時海平面下降,使西北太平洋邊緣海之間產(chǎn)生隔離,可能是兩個單倍型類群之間發(fā)生分化的原因。云鳚群體呈現(xiàn)中等程度的單倍型多樣性和較高的核苷酸多樣度,兩兩群體相比較的FST結(jié)果群體間不存在顯著的遺傳分化,F(xiàn)S檢驗和Tajima’s D檢驗以及核苷酸不配對分布結(jié)果均表明云鳚群體經(jīng)
6、歷過群體擴(kuò)張事件。同樣,我們擴(kuò)增了云鳚線粒體控制區(qū)全序列(853bp),識別出了終止序列區(qū)、中央保守區(qū)和保守序列區(qū),云鳚的線粒體控制區(qū)結(jié)構(gòu)與方氏云鳚的研究結(jié)果相似。
基于傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)標(biāo)記和線粒體DNA分子標(biāo)記對方氏云鳚和云鳚間的差異進(jìn)行比較。采用主成分分析、判別分析和聚類分析對采自北黃海的方氏云鳚群體和大連長海的云鳚群體形體特征進(jìn)行了分析,方氏云鳚和云鳚間存在明顯的差異。而在分節(jié)特征方面,方氏云鳚和云鳚各指標(biāo)的范圍存在一定的交疊
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