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文檔簡介
1、本文樣品來自2010年12月-2011年4月期間魯榮漁第6177和6178號(hào)漁船在西南大西洋阿根廷公海拖網(wǎng)所得漁獲物,運(yùn)用傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)標(biāo)記和線粒體DNA分子標(biāo)記方法對(duì)部分經(jīng)濟(jì)魚種進(jìn)行了形態(tài)學(xué)和遺傳學(xué)分析研究。主要研究結(jié)果如下:
1.運(yùn)用魚類DNA條形碼通用引物擴(kuò)增并測定了西南大西洋海域14種海洋魚類共計(jì)71個(gè)樣品的線粒體細(xì)胞色素C氧化酶亞基I(COI)基因約652bp的片段。序列組成成分的分析結(jié)果顯示,10種硬骨魚的GC含量高于
2、4種軟骨魚綱鰩類的GC含量;種內(nèi)、屬內(nèi)、科內(nèi)和目內(nèi)遺傳距離(K2P)平均值分別為0.0028,0.0335,0.1866和0.2361。通過構(gòu)建鄰接關(guān)系(Neighbor-joining)樹得到的物種聚類結(jié)果同形態(tài)學(xué)分類結(jié)果一致。研究證實(shí),在形態(tài)學(xué)分類資料缺乏的情況下, COI基因片段序列可以作為魚種鑒別的一種便捷有效的方式,亦可用于對(duì)魚類形態(tài)學(xué)分類系統(tǒng)進(jìn)行補(bǔ)充和修訂。
2.利用傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)方法對(duì)阿根廷無須鱈4個(gè)群體的18個(gè)可量
3、性狀和8個(gè)可數(shù)性狀進(jìn)行比較研究,并采用控制區(qū)第一高變區(qū)序列對(duì)SA3和SA4群體進(jìn)行進(jìn)一步的遺傳多樣性分析。阿根廷無須鱈4個(gè)群體的可數(shù)性狀值的分布范圍大體一致,難以作為群體劃分的依據(jù);可量性狀的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果表明各個(gè)群體間存在顯著差異(P<0.05)。控制區(qū)第一高變區(qū)分析結(jié)果表明阿根廷無須鱈具有較高水平的遺傳多樣性,單因子方差分析與遺傳分化分析的結(jié)果均顯示兩個(gè)群體之間雖然存在一定程度的遺傳分化,但分化水平不高,因此建議可以將兩個(gè)群體作為一
4、個(gè)種群進(jìn)行資源管理,以便于資源捕撈量的評(píng)估。
3.采用傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)方法對(duì)阿根廷鳀3個(gè)群體的18組可量性狀和8組可數(shù)性狀進(jìn)行了探討,主成分分析、單因子方差分析等統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果表明,阿根廷鳀3個(gè)群體之間的分化程度處于較低水平,并對(duì)其中2個(gè)群體(R2和R3)進(jìn)行了線粒體DNA控制區(qū)第一高變區(qū)序列的遺傳多樣性分析。擴(kuò)增得到437bp控制區(qū)第一高變區(qū)序列,根據(jù)其單倍型多樣度、核苷酸多樣度水平以及Tajima’sD和Fu’sFs中性檢驗(yàn)結(jié)果
5、,可以推斷該群體經(jīng)歷過近期擴(kuò)張事件。控制區(qū)第一高變區(qū)分析結(jié)果顯示阿根廷鳀的2個(gè)群體間具有較低遺傳分化水平,與形態(tài)學(xué)分析結(jié)果相一致,推斷本文所采集的3個(gè)阿根廷鳀群體實(shí)為同一種群分布在不同地理站位,應(yīng)視為一個(gè)種群進(jìn)行資源管理。
4.采用線粒體細(xì)胞色素氧化酶Ⅰ(COI)和細(xì)胞色素b(Cytb)基因2種分子標(biāo)記方法對(duì)阿根廷滑柔魚2個(gè)群體的遺傳變異進(jìn)行了研究。結(jié)果顯示,基于COI基因序列分析得到的結(jié)果顯示:檢測到34個(gè)單倍型,單倍型多樣
6、0.8692±0.0378、核苷酸多樣度0.0068±0.0039,兩兩序列比較的平均核苷酸差異度3.5915±1.8423。而基于Cytb基因序列分析結(jié)果顯示:檢測到31個(gè)單倍型,統(tǒng)計(jì)得出,單倍型多樣性指數(shù)0.9066±0.0244、核苷酸多樣性指數(shù)0.0073±0.0042及兩兩序列比較的平均核苷酸差異度3.0190±1.5913。2種分子標(biāo)記均揭示:阿根廷滑柔魚2個(gè)群體具有較高的單倍型多樣性指數(shù)和較低的核苷酸多樣性指數(shù)。兩兩群體間
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