玉米氣生根早期發(fā)育相關(guān)microRNA及其靶基因的鑒定.pdf

1、玉米(Zea mays L.)是世界上普遍種植的重要的谷類作物。它特有的氣生根可為玉米提供強(qiáng)大的抗倒伏能力；是玉米生長發(fā)育后期營養(yǎng)和水分吸收的主要器官；對于保證洪澇及干旱條件下玉米正常的產(chǎn)量有重要意義。MicroRNAs(miRNAs)是一類非編碼、內(nèi)源性的單鏈小分子量RNA，它們在植物的生長發(fā)育及脅迫響應(yīng)過程中發(fā)揮著重要的作用。然而，關(guān)于玉米氣生根起始及早期發(fā)育的miRNAs未見報(bào)道。
　　 為了鑒定在玉米氣生根早期發(fā)育過程中

2、發(fā)揮作用的miRNA，我們利用Solexa高通量測序技術(shù)對玉米生長發(fā)育V4階段獲得了未形成氣生根的莖節(jié)(N)，V6階段獲得含有剛突出氣生根的莖節(jié)(NR)，和經(jīng)過IAA處理后的含有剛突出氣生根的莖節(jié)(NRI)三個(gè)組織的樣本進(jìn)行測序得到了N，NR和NRI三個(gè)小分子RNA庫。通過與數(shù)據(jù)庫比對，分別從650,793(N)，957，303(NR)和1，082，948(NRI)種小RNA序列中得到了511，617和462種匹配上已知miRNA前體的

3、小分子RNA序列。進(jìn)一步的分析確定了137個(gè)保守miRNA(分屬于26個(gè)家族)以及159個(gè)新發(fā)現(xiàn)的非保守miRNA。其中，通過差異性分析分別得到了19個(gè)保守的和25非保守的氣生根相關(guān)的miRNAs，并通過qRT-PCR技術(shù)確認(rèn)了其中14個(gè)保守的和16個(gè)非保守的miRNA，以及15個(gè)受miRNA調(diào)控的靶基因。另外，我們還發(fā)現(xiàn)除了氮、磷、碳，生長素也在氣生根發(fā)育過程中發(fā)揮調(diào)節(jié)作用。
　　 本研究第一次分析了可能的氣生根起始和早期發(fā)育