條班紫菜和壇紫菜SSR遺傳多樣性分析.pdf

1、條斑紫菜(Pyropiayezoensis)和壇紫菜(Pyropia haitanensis)是我國兩種最重要的經(jīng)濟海藻，為我國創(chuàng)造了很大一部分的經(jīng)濟價值，因此了解其遺傳背景對于開展紫菜的大規(guī)模栽培和進(jìn)行遺傳育種來說非常重要。
　　 本論文主要包括以下內(nèi)容：對壇紫菜和條斑紫菜微衛(wèi)星引物擴增條件進(jìn)行篩選優(yōu)化，最終確定最優(yōu)的擴增條件；利用篩選出來的SSR引物對11個壇紫菜樣品進(jìn)行遺傳多樣性分析；利用篩選出的SSR引物對青島、日照、連

2、云港、威海、煙臺5個地理群體樣品進(jìn)行遺傳多樣性分析。
　　 主要結(jié)果如下：
　　 (1)對軟件分析出的簡單重復(fù)序列設(shè)計引物，得到壇紫菜和條斑紫菜SSR引物各36對和46對。通過不同擴增條件的優(yōu)化篩選(主要是退火溫度的優(yōu)化)，篩選出可以擴增出單一條帶的壇紫菜和條斑紫菜SSR引物各19對和12對，用于后期對壇紫菜和條斑紫菜的遺傳多樣性分析。
　　 (2)用篩選出的12對條斑紫菜SSR引物對從青島、日照、連云港、威海和

3、煙臺的野生群體和栽培群體進(jìn)行遺傳多樣性分析，11對引物具有多態(tài)性，共得到28個等位基因，平均每個位點的等位基因為2.55，位點遺傳多樣性比率(P)為91.67％。來自5個不同地理群體的SSR位點平均等位基因數(shù)(Na)、平均有效等位基因數(shù)(Ne)、平均Shannon多樣性指數(shù)(H)和香農(nóng)指數(shù)(I)分別為2.0000，1.4610，0.2862和0.4438。多態(tài)性指數(shù)最高和最低的引物分別是S12和PYM33。
　　 5個地理群體的

4、遺傳結(jié)構(gòu)分析表明，煙臺野生群體具有較高的遺傳多樣性，最低的是日照和連云港群體。其中，野生群體的平均觀測等位基因數(shù)(Na)、平均有效等位基因數(shù)(Ne)、平均多樣性指數(shù)(H)和香農(nóng)指數(shù)(I)分別為2.0000、1.4356、0.2746和0.4311，均高于栽培群體(Na=1.8571，Ne=1.4141，H=0.2611，I=0.4036)，表明目前我國條斑紫菜野生群體仍然保持較高的遺傳多樣性，栽培群體由于栽培過程中定向選擇的作用，使得其

5、遺傳多樣性低于野生群體。
　　 群體間遺傳分化結(jié)果顯示，群體間的遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.1345，表明5個群體總的遺傳變異中有13.45％來自群體間，群體內(nèi)的遺傳變異為86.55％。說明群體間的遺傳分化水平很低，遺傳變異絕大部分存在于群體內(nèi)。
　　 (3)用篩選出的19對壇紫菜SSR引物對本實驗室分離的11個壇紫菜純系材料進(jìn)行遺傳多樣性分析，其中10對引物具有多態(tài)性，共得到27個等位基因，多態(tài)位點百分率(P)為52.

6、6％。平均等位基因數(shù)(Na)、平均有效等位基因數(shù)(Ne)、Nei基因多樣性指數(shù)(H)和Shannon多樣性指數(shù)(I)為1.9，1.4370，0.2712，0.4180，其中各項指數(shù)都以引物E7最大(Na=2.0，Ne=1.7901，H=0.4382，I=0.6294)、S3最小(Na=1.5，Ne=1.2382，H=0.1614，I=0.2518)。利用這10對引物分析11個壇紫菜品系，壇紫菜11個品系間的遺傳相似度在0.5185～0.