茄子種質資源遺傳多樣性SSR和SRAP分析.pdf

1、茄子(SolanummelongenaL.)起源于亞洲南部熱帶地區(qū),古印度為其最早的馴化地,中國栽培茄子的歷史悠久,被認為是第二起源地,擁有豐富的茄子種質資源。進行茄子種質資源的遺傳多樣性研究,對茄子種質資源的搜集、保存、鑒定、創(chuàng)新及育種工作都有重要意義。本試驗對來自中國13個地區(qū)及印度、法國等35個國家的222份茄子種質資源,利用SSR和SRAP兩種分子標記方法進行了遺傳多樣性分析。主要結果如下:
　　 1.采用正交試驗設計,

2、從Mg2+、Taq酶、dNTPs、引物及模板5種因素4個水平對SSR反應體系進行優(yōu)化,建立了適合于茄子的SSR-PCR優(yōu)化反應體系,即10μL反應體系組成為:10×Buffer1μL,25mmol/LMg2+1.5μL,2.5mmoL/LdNTPs0.8μL,10μmoL/L引物1.0μL,50ng/μL模板DNA1.5μL,5U/μLTaq酶0.1μL,無菌水3.2μL。
　　 2.從供試材料中選取形態(tài)學上差異較大的5份栽培茄

3、和3份野生茄材料用于引物篩選。從416對SSR引物中篩選出5對多態(tài)性高、條帶清晰的引物;從431對SRAP引物中篩選出25對重復性好的多態(tài)性引物。
　　 3.利用篩選出的5對SSR引物和25對SRAP引物對供試的222份茄子材料進行PCR擴增,5對SSR引物共擴增出23條清晰度高、重復性好的條帶,平均每對引物產(chǎn)生4.6條,具有多態(tài)性的條帶為22條,占總擴增帶的96％。其中栽培茄產(chǎn)生的多態(tài)性條帶比例為65.2%。25對SRAP引物

4、共擴增出239條清晰度高、重復性好的條帶,平均每對引物產(chǎn)生9.6條,多態(tài)性條帶比例為100%。其中栽培茄產(chǎn)生的多態(tài)性條帶比例為74.9%。
　　 4.應用Structure軟件對擴增結果進行遺傳多樣性和群體結構分析,將供試材料分為5個亞類群——S1、S2、S3、S4、S5,分別包括31、11、66、51和63份材料;類群的劃分與地理來源存在一定關系:S1類群材料大都來自尼日利亞等非洲西南部國家,S2類群材料大都來自多哥等非洲國家

5、,S3材料大都來自中國、印度等亞洲國家,S4類群材料來自土耳其等亞洲國家,S5類群材料大都來自亞洲的中國。類群的劃分未能體現(xiàn)與果形和果色的直接相關性,但存在一定的規(guī)律:淺綠和白色茄子材料主要分布在S1和S3類群,綠色茄子材料主要分布在S2類群,深色(黑和紫)茄子材料則主要分布在S3、S4和S5類群;扁圓形狀的茄子材料主要分布在S1和S2類群,長筒、卵圓、長卵和圓球性狀的茄子材料主要分布在S3、S4和S5類群。
　　 5.基于St