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文檔簡介
1、本實驗采用RACE PCR技術(shù)和巢氏PCR方法分別從褶紋冠蚌和三角帆蚌中克隆到硫氧還蛋白(Trx)和葡萄糖調(diào)節(jié)蛋白78(Grp78)基因的cDNA全長序列。通過熒光定量PCR技術(shù)分析了Trx在褶紋冠蚌血細胞、肝胰腺、鰓、外套膜和肌肉組織中的表達,以及PBS刺激和金黃色葡萄球菌刺激后其在褶紋冠蚌五種組織中的表達變化。利用半定量RT-PCR分析Grp78基因在三角帆蚌的五個組織中表達,以及冷、熱休克誘導(dǎo)后Grp78基因在三角帆蚌的五個組織中
2、表達變化。
1、CpTrx基因序列1169 bp(登錄號:KC209545),其中5'非編碼區(qū)(UTR)長11bp,3'非編碼區(qū)長840 bp,含有PolyA尾和典型的腺苷酸信號序列AATAAA,開放閱讀框(Open Reading Frame,ORF)長度為318 bp,編碼105個氨基酸。預(yù)測蛋白質(zhì)分子量為11.79 kDa,等電點為5.38,不含有信號肽。氨基酸序列中含有1個Thioredoxin結(jié)構(gòu)域(T3-K10
3、4),區(qū)域內(nèi)包含一個保守的CGPC活化位點。序列同源性比較結(jié)果顯示褶紋冠蚌Trx與太平洋牡蠣(Crassostrea gigas)和紫貽貝(Mytilus galloprovincialis)的氨基酸序列一致性分別為56%和52%。預(yù)測的Trx空間結(jié)構(gòu)由5個β折疊和4個α-螺旋組成,α-螺旋包圍β折疊形成緊密的球形,這一結(jié)構(gòu)與人的Trx空間結(jié)構(gòu)相似。Trx mRNA在血細胞、肝胰腺、鰓、外套膜、閉殼肌中均有表達,在鰓中表達量最高,其次是
4、肝胰腺。金黃色葡萄球菌刺激褶紋冠蚌后,與PBS相比,各組織中的Trx表達量上升,血細胞中12h達到最高點后逐漸降低,48h最低但仍比空白對照高;肝胰臟中12h到48h一直升高到最大;鰓中12h明顯升高,并達到最大值,然后開始降低直至空白對照以下;外套膜中12h和24h的表達量逐漸降低,36h的表達量升高,達到最大值,48h的表達量再次降低至空白對照以下;閉殼肌中12h明顯升高,并達到最大值,24h、36h、48h的表達量明顯降低并至空白
5、對照以下。
2、HcGrp78基因cDNA全長為3721 bp,其中5'UTR長度為148 bp,3'UTR長度為1578 bp,包含1個AATAA加尾信號和一個多聚腺苷酸ploy(A)尾,開放閱讀框長度為1995 bp,預(yù)測編碼664個氨基酸。預(yù)測HcGrp78蛋白分子量為73.27kDa,理論等電點為4.99。N端有一段長度為22個氨基酸的信號肽(Met-Gla22)。第44-51個氨基酸、第232-245個氨基酸及第
6、369-383個氨基酸為3個HSP70家族的簽名序列(Signature sequence),分別為IDLGTTYS、VFDLGGGTFDVSLL和VVLVGGSTRIPKVQQ.含有16個絲氨酸磷酸化位點和、8個蘇氨酸磷酸化位點、4個酪氨酸磷酸化位點。序列同源性比較結(jié)果顯示三角帆蚌Grp78與其他物種高度保守,同源性在92%以上。HcGrp78 mRNA在三角帆蚌肌肉、外套膜、鰓、肝胰腺和血細胞中均有表達。4℃冷刺激后,與正常溫度20
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