朱砂葉螨miRNA鑒定及其在敏感和抗藥性品系的表達(dá)差異.pdf

1、朱砂葉螨（Tetranychus cinnabarinus）是重要的世界性害螨，因其個(gè)體小、繁殖速度快、移動(dòng)范圍小、接觸藥劑機(jī)會(huì)多和近親繁殖率高等特點(diǎn)而極易產(chǎn)生抗藥性。miRNAs（microRNAs）是一種大小為21nt左右，由真核生物基因組編碼的內(nèi)源性，具有調(diào)控功能的非編碼RNA，它通過5'端種子序列2～8位核苷酸與靶基因mRNA3'端UTR區(qū)互補(bǔ)配對識(shí)別，降解靶基因mRNA或抑制mRNA的翻譯，從而調(diào)控基因的表達(dá)。為了解miRNA

2、s的調(diào)控作用是否與朱砂葉螨抗藥性的產(chǎn)生有關(guān)，我們利用Illumina HiSeq2000測序平臺(tái)第一次對朱砂葉螨small RNA進(jìn)行測序，鑒定朱砂葉螨miRNA并研究其在甲氰菊酯抗性品系和敏感品系中的表達(dá)。主要研究結(jié)果如下:
　　1.通過small RNA測序，在朱砂葉螨甲氰菊酯抗性品系FeR中獲得24796487條reads，在敏感品系SS中獲得22001867條reads。通過篩選，發(fā)現(xiàn)sRNA(18～30nt)的在FeR中

3、為21232699條，其中的7014169條(33.56％)能匹配上二斑葉螨(Tetranychus urticae)基因組;在SS中為19657179條，其中的6578128條(33.21％)能匹配上二斑葉螨(Tetranychusurticae)基因組，長度主要集中在20nt(15.23％)、21nt(22.60％)、22nt(19.10％)、23nt(10.20％)。
　　2.將sRNA與miRBase20中二斑葉螨miRN

4、A序列進(jìn)行比對，共鑒定了75個(gè)已知的miRNA成熟體和45個(gè)前體;預(yù)測了93個(gè)新的miRNA成熟體和64個(gè)前體。一共預(yù)測了26202個(gè)靶基因，發(fā)現(xiàn)了55個(gè)可能與昆蟲抗性相關(guān)的靶基因，這些抗性相關(guān)的靶基因可能受到了39個(gè)已知的miRNA和33個(gè)新的miRNA的調(diào)控。通過miRNA堿基編輯分析，發(fā)現(xiàn)SS中發(fā)生堿基編輯的位點(diǎn)數(shù)僅為210977個(gè)，而FeR中為390968個(gè)。
　　3.將抗性品系和敏感品系miRNA表達(dá)量進(jìn)行對比，共發(fā)現(xiàn)1