稻瘟病菌誘導(dǎo)水稻特異表達(dá)EST數(shù)據(jù)庫的建立及相關(guān)基因鑒定.pdf

1、1該研究對(duì)受稻瘟病菌誘導(dǎo)水稻葉組織特異表達(dá)cDNA文庫進(jìn)行了大規(guī)模測(cè)序,共獲得有效EST序列15396條,其中14975條EST序列已被國際公共數(shù)據(jù)庫——GenBank數(shù)據(jù)庫接受.通過對(duì)所有已知功能基因的分析發(fā)現(xiàn),數(shù)據(jù)庫中與已知植物抗逆相關(guān)的蛋白有66類.涉及苯丙烷類代謝、氧代謝、氧化還原反應(yīng)、病程相關(guān)蛋白以及植物抵御高溫脅迫、低溫脅迫、光脅迫、水脅迫、植物創(chuàng)傷等相關(guān)的蛋白.證實(shí)水稻防御稻瘟病菌侵染的抗病過程是涉及眾多基因共表達(dá)的一個(gè)復(fù)

2、雜的網(wǎng)絡(luò)體系,并且與其它生物因子、非生物因子脅迫處理之間存在著密切的聯(lián)系.2有意思的是:通過與稻瘟病菌全基因組序列數(shù)據(jù)庫和水稻全基因組序列數(shù)據(jù)庫的BLASTn比對(duì),對(duì)5633條獨(dú)立基因進(jìn)行篩選,共檢出來源于稻瘟病菌的基因16條.3利用前期大規(guī)模測(cè)序的表達(dá)序列標(biāo)簽,制備完成容量為1106條獨(dú)立基因的cDNA微陣列,對(duì)抗瘟性近等基因系H7R和H7S的表達(dá)譜分析發(fā)現(xiàn):在水稻樣本受到稻瘟病菌侵染8小時(shí)后,眾多的基因表達(dá)發(fā)生變化,在980組有效數(shù)