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1、天津大學(xué)碩士學(xué)位論文人類蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫可靠性的衡量姓名:劉喆申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):生物化工指導(dǎo)教師:趙學(xué)明20090601ABSTRACTWiththeadventofpostgenomicandsystemsbiologyeramoreandmoreatten“onandresearchhavebeenpaidtoproteinsandprotein。proteininteractionsItnotonlvbecausepro
2、teinsareimportantconstitutiveandfunctionalcomponents,theYalsoplaycrucialrolesinhumanbiologicalprocessesAlthoughprotein。proteminteractiondatadepositedinpresentpubliclyaccessiblehumanprotein。proteininteraction(PPI)database
3、scouldofferagreatamountofusefulandevaluableinfomation,alargeproportionofdataaregeneratedfromhighthroughputexperimentwrhich釧rcnotoriousfortheirhighfalsepositiveandfalsenegativerateThus,inordertoallowresearcherseffectively
4、andcorrectlyutilizethesedatabases,itisimportanttoevaluatetheirreliabilityBecausedatainsignaltransductiondatabasesarewellinvestigatedanarevalidatedseveraltimes,itcouldbeutilizedtoevaluatethereliabilityofdatainPPIdatabases
5、ThroughcomparisonofdatafromPPIandsignaltransductiondatabases,wecaiculatednumberofcommonproteins,overlapofprotein。proteininteractions,consen,ationrat沁andvalueofX/S2cItrevealsthatprotein。proteininteractiondatainPPIi【atabas
6、esarenotreliableandalotofdatarecoredinsignaltransductiondatabasesarenotincludedinPPIdatabases,thereforeproteinproteininteractiondatainPPIdatabasescouldnotrepresentrealproteinproteininteractionnetworkFurthe咖oresubcellular
7、locationinformationinGOdatabasehasbeenusedtolaunchthesubcelluardistributionanalysisandwefoundthatproteinandproteinproteminteractiondistributioninPPIandsignaltransductiondatabasesarenotevenKEYWORDS:human,proteinproteinint
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