27967.原綠球藻和聚球藻密碼子使用偏好和適應(yīng)性進(jìn)化研究

1、溫州醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文原綠球藻和聚球藻密碼子使用偏好和適應(yīng)性進(jìn)化研究姓名：俞通海申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：遺傳學(xué)指導(dǎo)教師：包其郁20100501溫州醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文大。在原綠球藻中精氨酸(Arg)、亮氨酸(Leu)、纈氨酸(Val)、蘇氨酸(Thr)、絲氨酸(Ser)、脯氨酸(Pro)、異亮氨酸(11e)、甘氨酸(GIy)及谷氨酸(Glu)等氨基酸均偏好使用AGA、UUA、GUU、ACU、CCA、UCA、UCU、AUU、GGU及CAA等

2、密碼子編碼；而在聚球藻中，這些氨基酸則更喜歡使用CGC、CUG、GUG、ACC、CCC、AGC、AUA、GGC以及CAG等密碼子。而且聚球藻偏好使用最優(yōu)密碼子，而原綠球藻則更使用的較少。2通過對(duì)兩類藍(lán)藻密碼子使用影響因素的分析，我們發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致兩類藍(lán)藻密碼子使用方式不同的原因并不一致。原綠球藻主要由于基因組組成和突變的作用，而聚球藻則更多是受選擇作用的影響。3通過比較基因組學(xué)分析，我們發(fā)現(xiàn)兩類藍(lán)藻的進(jìn)化速率并不一致，聚球藻進(jìn)化速率明顯快于原

3、綠球藻。而且聚球藻中有66個(gè)基因檢測(cè)到了正選擇信號(hào)，而在原綠球藻中只發(fā)現(xiàn)了63個(gè)。結(jié)論：本研究中我們通過比較基岡組學(xué)方法首次系統(tǒng)而深入的對(duì)兩類海洋單細(xì)胞藍(lán)藻進(jìn)行密碼子偏好使用分析和進(jìn)化機(jī)制及適應(yīng)性進(jìn)化研究，發(fā)現(xiàn)盡管他們親緣關(guān)系非常相近，但是他們的密碼子使用方式差異非常大，而且導(dǎo)致他們密碼子使用方式不同的原因也各不相同，原綠球藻密碼子使用主要受基因組組成限制和突變作用，而聚球藻則受選擇作用更大。同時(shí)，對(duì)進(jìn)化速率的分析，我們發(fā)現(xiàn)兩類藻在進(jìn)化