野油菜黃單胞菌不同地域分離株基因組結(jié)構(gòu)與表型分析.pdf_第1頁
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1、對(duì)已完成全基因測(cè)序的兩個(gè)野油菜黃單胞菌菌株Xcc 8004和XccATCC33913的基因組結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,結(jié)果表明在編碼蛋白水平上,兩個(gè)基因組達(dá)97.5％的同源性,而在基因組大小、結(jié)構(gòu)上存在一定差異.主要差異包括:(1)8004的基因組比33913大72,538bp;(2)基因組結(jié)構(gòu)上存在一個(gè)大片段、兩個(gè)小片段倒置重排,以及一個(gè)移位重排;(3)8004中有兩個(gè)菌株特異基因島(giX8-a、giX8-b),33913有一個(gè)菌株特異基因島(

2、giX3-a);(4)8004在白蘿卜白沙南畔洲晚蘿卜栽培種上的相對(duì)致病力比33913高.以8004及33913基因組結(jié)構(gòu)為參照,采用PCR及Southern blotting方法對(duì)20株中國不同地域Xcc分離菌株的基因組進(jìn)行分析,結(jié)果表明所有菌株基因組里都含有與Xcc 8004和33913相似的致病相關(guān)基因簇(gum、hrp、LPS、type Ⅱ secretory system).而在基因組結(jié)構(gòu)上,不同地域分離株與8004或3391

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