25819.鈍頂節(jié)旋藻螺旋手性的變異規(guī)律與scar分子標(biāo)記研究

1、浙江大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院碩士學(xué)位論文鈍頂節(jié)旋藻螺旋手性的變異規(guī)律與SCAR分子標(biāo)記研究姓名：潘劍用申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：生物物理學(xué)指導(dǎo)教師：汪志平20100301三、基于RAPD的節(jié)旋藻螺旋手性相關(guān)SCAR分子標(biāo)記的研究依據(jù)上述在Sp1和Sp1(L)中10條多態(tài)性DNA片段(編號(hào)01～10)的序列，通過(guò)PrimerPremier50軟件搜索與評(píng)價(jià)，設(shè)計(jì)了含全部或部分RAPD隨機(jī)引物、長(zhǎng)度為2025mer的SCAR引物(對(duì)應(yīng)編號(hào)Sc0

2、1～Sol0)，進(jìn)而在原藻株及其它藻株中進(jìn)行多態(tài)性驗(yàn)證，篩選出與節(jié)旋藻螺旋手性相關(guān)的DNA片段或基因，并作生物信息學(xué)分析。主要結(jié)果如下：(1)在用于驗(yàn)證的5對(duì)左手性螺旋和手中性對(duì)應(yīng)的藻株[Sp一1和Sp1(L)、Sp一3和Sp3(L)、Sp3和Sp3(L)l、Sp10和Sp10(L)、Sp一12和Sp12(L)】，以及3株左手螺旋藻株[Sp一8、Sp9$ISp一1(L專S)】中，只有Se05保持能區(qū)分藻絲為螺旋手性和手中性的多態(tài)性，li

3、I]Sc05在螺旋手性藻絲中無(wú)擴(kuò)增條帶，而在手中性藻絲中有。因此，Sc05為從RAPD標(biāo)記轉(zhuǎn)化成功的SCAR標(biāo)記，其擴(kuò)增產(chǎn)物很可能是與節(jié)旋藻螺旋手性相關(guān)的DNA片段或基因。(2)Sc05擴(kuò)增產(chǎn)物的長(zhǎng)度為527bp，從30位堿基起有1個(gè)含起始密碼子的正向ORF，對(duì)應(yīng)165個(gè)氨基酸，所編碼的蛋白質(zhì)與細(xì)菌中硫酸酯酶同源物AtsG的前165位氨基酸具有較高相似性(63％)，且含有1個(gè)硫酸酯酶家族的保守結(jié)構(gòu)域，因而將這一在節(jié)旋藻中的硫酸酯酶同源物