豬繁殖性狀相關(guān)候選基因MAN2B2，mSR和RGS12的遺傳效應(yīng)分析.pdf

1、繁殖性狀是非常重要的經(jīng)濟(jì)性狀，產(chǎn)仔性能的高低直接影響?zhàn)B豬業(yè)的生產(chǎn)效益。根據(jù)國(guó)內(nèi)外報(bào)道的QTL定位結(jié)果、豬-人比較圖譜以及基因的生理生化功能，分別選取了三個(gè)影響排卵率的候選基因MAN2B2(a-Mannosidase2,B2，a-甘露糖苷酶2,B2)，RGS12(regulatorsofGproteinsignaling12，G蛋白信號(hào)調(diào)節(jié)子12)和mSR(membranesteroidreceptor，膜類固醇受體)基因。應(yīng)用比較基因組

2、學(xué)、生物信息學(xué)等方法分離鑒定了這些基因，并以清平豬、新清平母系(由清平豬與杜洛克豬雜交形成的品系)、中國(guó)瘦肉豬新品系DⅣ1系、DⅣ2系為材料，研究了這些基因的多態(tài)性位點(diǎn)與豬繁殖性狀的相關(guān)性。具體結(jié)果如下： 一、MAN2B2基因的遺傳效應(yīng)分析結(jié)果： 1)獲得梅山豬，清平豬，大白豬，杜洛克豬MAN2B2基因部分基因組序列，并提交到NCBI的GenBank，分別獲得登錄號(hào)：AY847942、AY847943、AY847944和

3、AY847945。經(jīng)比對(duì)分析在不同品種豬基因組擴(kuò)增序列中檢測(cè)到7個(gè)SNPs，內(nèi)含子163處G/T替換的SNP引起了MspⅠ酶切多態(tài)性，建立了該位點(diǎn)的PCR-MspⅠ-RFLP基因分型方法。 2)在7個(gè)不同品種品系中檢測(cè)了MAN2B2基因MspⅠ-RFLP基因型頻率和等位基因頻率分布，僅在中國(guó)豬種清平豬和梅山豬中發(fā)現(xiàn)了BB基因型，x2檢驗(yàn)結(jié)果表明等位基因頻率在清平豬和梅山豬兩個(gè)群體之間的差異不顯著，但都與其他群體之間存在顯著或極顯

4、著差異。 3)在78頭清平豬和69頭新清平母豬中進(jìn)行MAN2B2基因MspⅠ-RFLP標(biāo)記與繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果表明該位點(diǎn)在清平經(jīng)產(chǎn)母豬中BB型比AA型平均產(chǎn)仔數(shù)高1.74頭，并與產(chǎn)仔數(shù)性狀差異顯著(P＜0.05)，B等位基因?yàn)橛欣任换?，單拷貝可提高產(chǎn)仔數(shù)0.82頭/窩，且加性效應(yīng)顯著(P＜0.05)。 二、mSR基因的遺傳效應(yīng)分析結(jié)果： 1)獲得梅山豬、大白豬和清平豬mSR基因exon2部分編碼區(qū)序列，

5、經(jīng)比對(duì)分析共檢測(cè)到18個(gè)SNPs，其中該基因編碼區(qū)827bp處A/G替換的SNP導(dǎo)致氨基酸改變(Arg-Gln)，引起了MspⅠ酶切多態(tài)性，建立了PCR-MspⅠ-RFLP方法酶切分型方法。mSR基因exon2編碼區(qū)序列869bp處的A/G替換可用HhaⅠ酶切分型，但該位置編碼的氨基酸未改變，建立了該位點(diǎn)的PCR-HhaⅠ-RFLP分型方法。 2)在清平豬、新清平母系、中國(guó)瘦肉豬新品系DⅣ1系和DⅣ2系4個(gè)不同群體中檢測(cè)mSR基

6、因HhaⅠ-RFLP酶切位點(diǎn)的基因型頻率和等位基因頻率分布，結(jié)果發(fā)現(xiàn)都存在三種基因型，在新清平母系中，等位基因頻率差異最大，中國(guó)瘦肉豬新品系DⅣ1系、DⅣ2系中等位基因差異不大；x2檢驗(yàn)結(jié)果表明等位基因在清平豬與新清平豬群體之間的頻率分布差異不顯著，但都與DⅣ1系、DⅣ2系存在極顯著差異(P＜0.01)。 3)統(tǒng)計(jì)了清平豬、新清平母系、中國(guó)瘦肉豬新品系DⅣ1系、DⅣ2系4個(gè)群體中mSR基因HhaⅠ-RFLP不同基因型與繁殖性狀的

7、相關(guān)性，結(jié)果表明在新清平母系和中國(guó)瘦肉豬新品系DⅣ中AA基因型產(chǎn)仔數(shù)高于BB基因型，其中新清平母系初產(chǎn)母豬中AA型和BB型產(chǎn)仔數(shù)差異極顯著(P＜0.01)，加性效應(yīng)為1.21±0.58；但在清平豬中則相反，AA型和BB型產(chǎn)仔數(shù)差異顯著(P＜0.05)，加性效應(yīng)為-1.32±0.19。 4)在清平豬、新清平母系、中國(guó)瘦肉豬新品系DⅣ1系、DⅣ2系4個(gè)群體中檢測(cè)mSR基因MspⅠ-RFLP酶切位點(diǎn)的基因型頻率和等位基因頻率分布，在所

8、檢測(cè)的4個(gè)群體中均存在三種基因型，在清平豬中，等位基因頻率差異最大，其他群體內(nèi)差別不大。x2檢驗(yàn)結(jié)果表明等位基因在清平豬與新清平豬群體之間的頻率分布差異不顯著，但都與DⅣ1系、DⅣ2系差異極顯著。 5)統(tǒng)計(jì)了清平豬、新清平母系、中國(guó)瘦肉豬新品系DⅣ1系、DⅣ2系4個(gè)群體中mSR基因MspⅠ-RFLP不同基因型與繁殖性狀的相關(guān)性，結(jié)果表明在清平經(jīng)產(chǎn)母豬中AA基因型和BB基因型死胎數(shù)目差異極顯著(P＜0.01)，加性效應(yīng)顯著(P＜0

9、.05)；在中國(guó)瘦肉豬新品系DⅣ中AB基因型和BB基因型死胎數(shù)目極顯著(P＜0.01),加性效應(yīng)顯著(P＜0.05)。 三、RGS12基因的遺傳效應(yīng)分析結(jié)果： 根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道，位于豬8號(hào)染色體上的RGS12基因與微衛(wèi)星標(biāo)記SB73緊密連鎖，采用最小二乘法，在有繁殖性狀記錄的65頭清平豬和67頭新清平母系中，研究了RGS12基因微衛(wèi)星多態(tài)性與繁殖性狀的相關(guān)性。統(tǒng)計(jì)結(jié)果表明，在清平母豬中，DD基因型母豬產(chǎn)仔數(shù)最多，BB型最少，