邊雞遺傳多樣性及Myostatin基因?qū)ιL(zhǎng)和繁殖性狀的遺傳效應(yīng)研究.pdf

1、本研究利用29個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記研究邊雞0世代群體的遺傳多樣性，并與2個(gè)對(duì)照品種(京海黃雞和尤溪麻雞)的遺傳多樣性進(jìn)行比較；選擇0世代邊雞群體中等位基因數(shù)在4個(gè)以上的21個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記研究1世代邊雞群體的遺傳多樣性，并與0世代邊雞群體的遺傳多樣性進(jìn)行比較以了解邊雞群體的保種效果；采用PCR-SSCP技術(shù)檢測(cè)邊雞及3個(gè)對(duì)照品種(京海黃雞、尤溪麻雞和AA雞)肌肉生長(zhǎng)抑制素基因(Myostatin)的單核苷酸多態(tài)性，并與邊雞的生長(zhǎng)和繁殖性狀進(jìn)行相關(guān)分

2、析，為邊雞群體的標(biāo)記輔助選擇提供依據(jù)；運(yùn)用熒光定量PCR技術(shù)分析邊雞Myostatin基因G2283A位點(diǎn)形成的3種基因型在胸肌、腿肌和卵巢中表達(dá)量的差異，以探討這一位點(diǎn)對(duì)邊雞的生長(zhǎng)性狀和繁殖性狀具有顯著效應(yīng)的分子機(jī)理，同時(shí)分析邊雞Myostatin基因在胸肌、腿肌和卵巢中表達(dá)量的差異。主要研究結(jié)果如下：
　　 1.利用29個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記在3個(gè)雞品種(邊雞、京海黃雞和尤溪麻雞)中總共檢測(cè)到166個(gè)等位基因，其中32個(gè)等位基因?yàn)槟骋?/p>

3、品種所特有。邊雞擁有的特有等位基因最多，為15個(gè)(46.9％)，京海黃雞次之，為12個(gè)(37.5％)。邊雞的平均多態(tài)信息含量(0.5168)和平均期望雜合度(0.5750)最高，京海黃雞的平均多態(tài)信息含量(0.4915)和平均期望雜合度最低(0.5505)。在29個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)中，邊雞群體有15位點(diǎn)為高度多態(tài)位點(diǎn)，其余14個(gè)位點(diǎn)為中度多態(tài)位點(diǎn)。京海黃雞和尤溪麻雞的高度多態(tài)位點(diǎn)數(shù)分別為17和14個(gè)。在3個(gè)品種中一些位點(diǎn)顯著的偏離哈代-溫伯格

4、平衡，雜合子缺失的水平也很高。通過(guò)固定指數(shù)(Fst)估計(jì)品種間的遺傳分化為6.7％(P＜0.001)。群體內(nèi)的雜合子缺失(Fis)為22.2％(P＜0.001)。邊雞的近交系數(shù)最高(0.249)，京海黃雞的最低(0.159)。這些研究結(jié)果可為邊雞、京海黃雞以及尤溪麻雞的遺傳特征研究和保種提供初步依據(jù)。
　　 2.選用的等位基因數(shù)在4個(gè)以上的21個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記在2個(gè)世代的邊雞群體中共檢測(cè)到122個(gè)等位基因，其中102個(gè)為兩個(gè)世代所共

5、有，19個(gè)為0世代所特有。0世代和1世代的邊雞群體的平均多態(tài)信息含量(PIC)分別為0.5473和0.5437；平均期望雜合度分別(He)為0.5967和0.6009；近交系數(shù)(Fis)分別為0.233和0.134。經(jīng)過(guò)一個(gè)世代的繁育，PIC和He兩個(gè)指標(biāo)維持在原有水平，而群體的近交系數(shù)有所下降，說(shuō)明采用的保種方法很好的保存了邊雞的遺傳多樣性，同時(shí)避免了近交程度過(guò)高而導(dǎo)致群體出現(xiàn)近交衰退。
　　 3.在4個(gè)雞品種Myostati

6、n基因中總共檢測(cè)到17個(gè)突變，其中10個(gè)突變(A326G、C334G、G673A、G985C、G1085A、A1278T、C1346T、G1375A、A1473G和G1491A)位于5'調(diào)控區(qū)，4個(gè)突變(G2100A、G2109A、C2244G和G2283A)位于外顯子1，3個(gè)突變(C7552T，C7638T和T7661A)位于外顯子3。編碼區(qū)的突變都未導(dǎo)致氨基酸的改變。
　　 4.邊雞、京海黃雞、尤溪麻雞和AA雞Myostat

7、in基因中分別有7、9、9和5個(gè)位點(diǎn)表現(xiàn)出多態(tài)。邊雞MYOE1-2位點(diǎn)為高度多態(tài)位點(diǎn)，MYO1和MYOE1-3位點(diǎn)為中度多態(tài)位點(diǎn)，其余4個(gè)位點(diǎn)為低度多態(tài)位點(diǎn)。京海黃雞、尤溪麻雞和AA雞中高度多態(tài)位點(diǎn)數(shù)分別為1、2、0個(gè)，中度多態(tài)位點(diǎn)數(shù)都為4個(gè)。
　　 5.通過(guò)在線軟件預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)4個(gè)雞品種Myostatin基因5'調(diào)控區(qū)的突變總共導(dǎo)致10個(gè)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)(E2F、CRE-BP、CREB、HFH-2、NKx-2、CdxA、Oct-1

8、、V-Maf、Tst-1和C/EBPα)發(fā)生了改變。
　　 6.邊雞Myostatin基因5'調(diào)控區(qū)MYO1、MYO6和MYO7位點(diǎn)以及外顯子區(qū)MYOE1-2、MYOE1-3位點(diǎn)對(duì)邊雞的生長(zhǎng)性狀具有顯著或極顯著的影響(P＜0.05或P＜0.01)，推測(cè)Myostatin基因可能是影響邊雞生長(zhǎng)性狀的主效基因或與主效基因相連鎖的一個(gè)標(biāo)記。MYOE1-3位點(diǎn)DE和EE基因型的6-18周齡體重都顯著或極顯著的高于EE基因型(P＜0.05

9、或P＜0.01)，并且具有EE基因型的體重＞DE基因型＞EE基因型的規(guī)律，MYOE1-3位點(diǎn)在邊雞生長(zhǎng)性狀的標(biāo)記輔助選擇方面具有很大的應(yīng)用潛力。
　　 7.邊雞Myostatin基因5'調(diào)控區(qū)MYO1、MYO6和MYO7位點(diǎn)對(duì)邊雞的開(kāi)產(chǎn)體重有顯著的影響(P＜0.05)，外顯子區(qū)MYOE1-2、MYOE1-3、MYOE3-2和MYOE3-3位點(diǎn)對(duì)邊雞的開(kāi)產(chǎn)日齡和300日齡產(chǎn)蛋數(shù)具有顯著或極顯著的影響(P＜0.05或P＜0.01)，

10、推測(cè)Myostatin基因可能是影響邊雞繁殖性狀的的主效基因或與主效基因相連鎖的一個(gè)標(biāo)記。MYOE1-3位點(diǎn)DE基因型的開(kāi)產(chǎn)日齡顯著的早于DD基因型(P＜0.05)，EE基因型的開(kāi)產(chǎn)日齡極顯著的早于DD基因型(P＜0.01)；MYOE1-3位點(diǎn)DE基因型的300日齡產(chǎn)蛋數(shù)顯著的高于DD基因型(P＜0.05)，EE基因型的300日齡產(chǎn)蛋數(shù)極顯著的高于DD基因型(P＜0.01)，MYOE1-3位點(diǎn)在邊雞300日齡產(chǎn)蛋數(shù)的標(biāo)記輔助選擇方面具有

11、很大的應(yīng)用潛力。
　　 8.邊雞Myostatin基因7個(gè)多態(tài)位點(diǎn)兩兩組合對(duì)邊雞的生長(zhǎng)性狀和繁殖性狀的互作效應(yīng)達(dá)到顯著(P＜0.05)或極顯著(P＜0.01)的水平。
　　 9.通過(guò)熒光定量PCR技術(shù)發(fā)現(xiàn)Myostatin基因G2283A位點(diǎn)形成的3種基因型(DD、DE和EE)在胸肌、腿肌中的表達(dá)量存在差異，在卵巢中的表達(dá)量沒(méi)有差異。在胸肌中，野生型(DD)的表達(dá)量是突變雜合型(DE)的表達(dá)量的1.40倍，是突變純合型(