楊樹抗黑斑病相關(guān)基因表達(dá)譜分析.pdf

1、　　表達(dá)序列標(biāo)簽(EST)和基因芯片技術(shù)是功能基因組學(xué)中常用的高通量研究方法。本研究同時(shí)運(yùn)用這兩種高通量技術(shù)，從基因表達(dá)整體水平研究楊樹在黑斑病菌致病過程中的抗病機(jī)制，可為楊樹抗黑斑病育種提供理論依據(jù)?！　”狙芯繉?個(gè)楊樹葉片cDNA文庫隨機(jī)挑取克隆進(jìn)行5’端測序，共獲得有效EST序列20023條，并遞交至GenBank數(shù)據(jù)庫，登錄號從CX167465到CX187487。序列經(jīng)拼接后，獲得10816個(gè)UniGene，其中3734個(gè)Co

2、ntig，7082個(gè)Singletons。8853個(gè)具有同源性匹配序列的基因中，按照GO的分子功能、生物過程和細(xì)胞組分三個(gè)不同分類角度分類，被賦予功能的基因數(shù)累計(jì)達(dá)21100個(gè)。經(jīng)對所有具有功能的基因研究發(fā)現(xiàn)，有兩類基因的含量較高，一類是楊樹葉片組織特異性相關(guān)的基因，另一類是楊樹葉片受外界脅迫表達(dá)的抗逆相關(guān)基因?！　≡诒緦?shí)驗(yàn)從3734個(gè)Contigs中得到94個(gè)堿基替代型侯選SNP，39個(gè)插入缺失型侯選SNP。利用SSRFinder軟