三個(gè)水稻電子遺傳圖譜的構(gòu)建和水稻品種指紋圖譜庫(kù)的初步研究.pdf

1、為了提高明恢86背景下突變體基因定位的效率，本研究利用均勻分布于水稻12條染色體上的1232對(duì)SSR引物(其中716對(duì)來(lái)自己報(bào)道的SSR引物，516對(duì)新開(kāi)發(fā)SSR引物)對(duì)明恢86與93-11、02428和中花15的多態(tài)性進(jìn)行PCR分析，并根據(jù)這些標(biāo)記及其標(biāo)記的遺傳距離(部分標(biāo)記直接引用McCouch等報(bào)道的遺傳距離，另一部分新開(kāi)發(fā)標(biāo)記的遺傳距離是根據(jù)物理距離推算)，利用Mapdraw.evenmarker軟件[109]繪制了三張基于水稻

2、明恢86的高密度電子遺傳圖譜(有別于傳統(tǒng)以分析群體基因型和重組率而構(gòu)建的遺傳圖譜，因此我們稱(chēng)之電子遺傳圖譜)。其中明恢86/9311電子遺傳圖譜包含的位點(diǎn)281個(gè)、標(biāo)記間平均距離為5.34cM，而明恢86/02428和明恢86/qp花15圖譜包含的位點(diǎn)多達(dá)473個(gè)和470個(gè)，標(biāo)記間的平均距離僅為3.22cM和3.23cM。本文完成六條染色體(染色體4-9號(hào))的明恢86/9311、明恢86/02428、明恢86/中花15圖譜的位點(diǎn)依次為1

3、33個(gè)、200個(gè)、214個(gè)，標(biāo)記間平均距離為5.22 cM、3.53 cM、3.35 cM，這三張高密度的電子遺傳圖譜的構(gòu)建為高通量初步定位明恢86背景下突變體基因創(chuàng)造了條件，同時(shí)也為另外3個(gè)水稻品種突變體基因的圖位克隆提供了方便。 同時(shí)，我們利用親緣關(guān)系比較有代表性12個(gè)水稻品種(包含電子遺傳圖譜的4個(gè)親本)對(duì)均勻分布于水稻染色體上的1232對(duì)SSR引物進(jìn)行多態(tài)性分析，篩選出3套均勻分布于12條染色體上的總共72對(duì)核心引物(每