IL-6R基因SNP及單體型與2型糖尿病關(guān)聯(lián)研究.pdf

1、糖尿病屬于復(fù)雜性疾病，2型糖尿病(type 2 diabetesmellitus，T2DM)是糖尿病的主要類(lèi)型，為遺傳因素和環(huán)境因素相互作用的產(chǎn)物。本文擬通過(guò)對(duì)白細(xì)胞介素6受體(interleukin 6recepor，IL-6R)基因多態(tài)性的研究，探討IL-6R與T2DM的關(guān)系。 人類(lèi)IL-6R基因定位于10q21.3，編碼的白細(xì)胞介素6受體蛋白(interleukin 6 recepor，IL-6R)，能特異性地和其配體白細(xì)

2、胞介素6(interleukin 6，IL-6)結(jié)合，形成IL-6R/IL-6復(fù)合物，引起信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)。IL-6是一種多功能的細(xì)胞因子，可由不同種類(lèi)細(xì)胞產(chǎn)生，如淋巴細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞、脂肪細(xì)胞等，在免疫和炎癥反應(yīng)中發(fā)揮重要作用。機(jī)體IL-6水平失調(diào)，可導(dǎo)致許多疾病的產(chǎn)生。研究表明<'[1,2]>，高濃度的IL-6能破壞胰島β細(xì)胞，誘導(dǎo)胰島素抵抗(Insulin Resistance，IR)，與糖尿病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。而IL-6的作用是由IL-

3、6R介導(dǎo)的，IL-6R是介導(dǎo)IL-6信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的“中介分子”，在IL-6信息傳導(dǎo)過(guò)程中起關(guān)鍵作用。有文獻(xiàn)報(bào)道，10q21.3區(qū)域與2型糖尿病連鎖<'[3,4]>，但以往的報(bào)道有種族遺傳異質(zhì)性。為此，我們擬了解中國(guó)漢族人群(chinese Hannationality poptulation，CHNP)的IL-6R基因是否與T2DM有關(guān)。 研究目的： (Single nucleotide polymorphism，SNP)及

4、其單體型(haplotype)分布特征的觀察，充實(shí)積累IL-6R基因在中國(guó)漢族人群(CHNP)的數(shù)據(jù)，并探討它們與T2DM的關(guān)系，為T(mén)2DM發(fā)病機(jī)理研究提供更多新的信息，為T(mén)2DM的預(yù)防治療提供新的理論依據(jù)。 研究方法： (1)通過(guò)美國(guó)國(guó)家生物信息中心(National Center of BiologyInformation，NCBI)的GenBank獲取IL-6R基因序列及其相應(yīng)位點(diǎn)的SNP信息。利用Primer P

5、remier 5.0引物設(shè)計(jì)軟件設(shè)計(jì)相應(yīng)引物，并經(jīng)NCBI的Blast 2.0軟件檢驗(yàn)其特異性。 (2)應(yīng)用群體-候選基因分析方法，以聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment LengthPolymorphism，PCR- RFLP)技術(shù)，對(duì)106例T2DM患者及102例正常對(duì)照IL-6R基因的2個(gè)SNP位點(diǎn)--第9外顯子D358A(rs81

6、92284)和啟動(dòng)子-183(G→A)(rs4845617)，進(jìn)行基因型檢測(cè)。 (3)應(yīng)用聚類(lèi)分析方法分析基因多態(tài)性特征。 研究結(jié)果： (1)IL-6R基因第9外顯子D358A位點(diǎn)(rs8192284)基因型頻率和等位基因頻率，在病例組和對(duì)照組分別為AA 0.443/0.304、AC0.415/0.421、CC 0.142/0.275；A 0.651/0.510、C0.349/0.490。兩組人群基因型頻率和等位

7、基因頻率均有顯著差異(x<'2>=7.149，P=0.029；x<'2>=8.511，P=0.04)。提示IL-6R基因第9外顯子D358A(rs8192284)是中國(guó)西南地區(qū)漢族人群T2DM的易感因子。 (2)IL-6R基因啟動(dòng)子-183(G→A)位點(diǎn)(rs4845617)基因型頻率和等位基因頻率，在病例組和對(duì)照組分別為GG 0.387/0.451、GA0.443/0.412、AA 0.170/0.137；G 0.585/0.

8、657、A 0.415/0.343。兩組基因型頻率和等位基因頻率均無(wú)顯著差異(x<'2>=0.992，P=0.634；x<'2>=2.285，P=0.157)。提示IL-6R基因啟動(dòng)子-183(G→A)(rs4845617)的多態(tài)性與中國(guó)西南地區(qū)漢族人群T2DM無(wú)關(guān)。 (3)2個(gè)SNP位點(diǎn)按第9外顯子D358A位點(diǎn)(rs8192284)、啟動(dòng)子-183(G→A)位點(diǎn)(rs4845617)順序，可以組成4種單體型，分別定為A<,1

9、>-G、A<,1>-A<,2>、C-G、C-A<,2>。其中，最常見(jiàn)的是A<,1>-G，在病人組及對(duì)照組的頻率為0.418/0.293(x<'2>=1.738，P=0.187480)；而差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的僅c-A<,2>，在病人組及對(duì)照組的頻率為0.110/0.273(x<'2>=4.383，P=0.036357)。提示單體型C-A<,2>可能與中國(guó)西南地區(qū)漢族人群T2DM存在關(guān)聯(lián)。 結(jié)論： (1)本研究首次揭示了中國(guó)西