BK通道三維結(jié)構(gòu)模擬研究.pdf

1、大電導(dǎo)鈣激活鉀離子（BK）通道是一類同時(shí)受控于膜電壓和胞內(nèi)鈣離子的特殊的鉀離子通道，它在很多重要的生理過(guò)程中有著非常重要的作用，如耳毛細(xì)胞的頻率調(diào)節(jié)和激素分泌、神經(jīng)遞質(zhì)的釋放、心率和血管的抗逆性等。因此，對(duì)BK通道結(jié)構(gòu)及調(diào)控機(jī)理的研究對(duì)于神經(jīng)科學(xué)以及心血管疾病的研究都有著重要意義。
　　 本論文利用BLAST對(duì)mslo1序列在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)（PDB 庫(kù)）中進(jìn)行同源性搜索：利用MODELLER對(duì)搜索結(jié)果中得分較高的跨膜區(qū)S1－S

2、6進(jìn)行同源建模，模板為Kv1.2通道的晶體結(jié)構(gòu)（PDB ID，2R9R）；而得分較低的N端部分則采用ROSETTA進(jìn)行從頭計(jì)算得到；RCK結(jié)構(gòu)直接利用hslo1的晶體結(jié)構(gòu)（PDB ID，3NAF）。參考MthK 通道以及電鏡實(shí)驗(yàn)結(jié)果組裝BK通道全結(jié)構(gòu)。
　　 通過(guò)與KCNQ1通道的序列比對(duì)，對(duì)比新得到的BK通道模型，發(fā)現(xiàn)S1上的兩個(gè)殘基（Y130、F131）和相鄰亞基的S5上的A250、以及孔區(qū)α螺旋上的W275之間形成了一個(gè)相