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文檔簡介
1、楊屬，作為具有重要經(jīng)濟(jì)和生態(tài)價(jià)值的落葉喬木樹種，其分布覆蓋整個(gè)北半球樹木分布的臨界范圍。不同楊屬樹種基因組全序列的測定，為通過比較關(guān)鍵等位基因的變異來研究不同楊屬樹種對不同環(huán)境的適應(yīng)機(jī)制提供了基礎(chǔ)。
本研究以毛果楊基因組為參照序列共設(shè)計(jì)64對特異性引物，對楊屬29個(gè)樹種 Na+/H+逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因家族（10個(gè)基因）進(jìn)行全長 PCR擴(kuò)增，運(yùn)用CodonCode Aligner軟件對序列數(shù)據(jù)進(jìn)行校對；通過PAML計(jì)算來檢測目的基
2、因是否在不同樹種間發(fā)生了結(jié)構(gòu)變異和適應(yīng)性進(jìn)化；用 DnaSP、MEGA和ARLEQUIN等軟件進(jìn)行DNA多態(tài)性分析，計(jì)算每個(gè)種的單倍型遺傳多樣性，并通過HKA和MKPRF等軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行計(jì)算和中性檢驗(yàn)，揭示Na+/H+逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因家族在楊屬種間的分子進(jìn)化機(jī)制。結(jié)果表明：白楊組的NHX5基因和胡楊組的NHX6、SOS1基因能夠檢測到正選擇信號(hào)；Na+/H+逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族基因在胡楊和灰楊野生群體中普遍經(jīng)歷了適應(yīng)性進(jìn)化。同時(shí)，研究發(fā)現(xiàn)胡
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