版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡(jiǎn)介
1、2002年11月,中國(guó)廣東出現(xiàn)了一種新的傳染病,嚴(yán)重急性呼吸道綜合癥(SARS),疾病迅速向全世界傳播,感染的死亡率約為10%。SARS冠狀病毒(SARS-Coy)被確認(rèn)為是這種傳染病的病原體。SARS在2003年冬天至2004年春天,出現(xiàn)了第二輪零星的發(fā)病個(gè)案。
SARS通過多種因素造成了肺部的損傷,發(fā)病機(jī)理十分復(fù)雜。宿主對(duì)病源體SARS冠狀病毒的反應(yīng)的分子機(jī)制仍然很不清楚。
本研究對(duì)一份SARS病人肺部尸
2、檢組織的樣本構(gòu)建了cDNA文庫(kù),并進(jìn)行詳盡的分析。文庫(kù)的構(gòu)建使用隨機(jī)引物,測(cè)序的10870個(gè)克隆可以拼接成270個(gè)拼接序列(contig)及7710個(gè)單克隆(singleton)。文庫(kù)中發(fā)現(xiàn)了SARS冠狀病毒的RNA序列及其他肺炎相關(guān)微生物的序列。
完成拼接的序列通過與人類基因組及核酸數(shù)據(jù)庫(kù)的比對(duì),確定了7872個(gè)序列來(lái)自人類肺部組織,這些序列中,僅有占總數(shù)14.10%的序列與人類蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中的序列具有顯著相似性,36.
3、56%的序列與人類核酸數(shù)據(jù)庫(kù)序列具有顯著相似性,其余大部分的序列是全新的轉(zhuǎn)錄本。同時(shí)發(fā)現(xiàn),587個(gè)序列與非編碼RNA具有顯著的相似性,其中283個(gè)序列既能與編碼基因比對(duì)得上,又能夠與非編碼轉(zhuǎn)錄本比對(duì)得上。這些結(jié)果與當(dāng)前在哺乳動(dòng)物基因組研究上的很多觀點(diǎn)一致,如大部分的基因組是轉(zhuǎn)錄的,總RNA中存在著大量的不具有Poly(A)尾巴的轉(zhuǎn)錄本(即poly A-RNA),轉(zhuǎn)錄的情況比原來(lái)的認(rèn)識(shí)要復(fù)雜得多等。
通過相似性搜索,本研究表
4、列整理出了文庫(kù)中免疫相關(guān)的基因,這有助于了解宿主免疫系統(tǒng)對(duì)SARS冠狀病毒感染的反應(yīng)。
本研究從NCBI dbEST數(shù)據(jù)庫(kù)中下載了來(lái)自腫瘤、胎兒及正常成人等6個(gè)人類肺部cDNA文庫(kù),通過基因本體論(GO)的注釋系統(tǒng),將SARS冠狀病毒感染的文庫(kù)與這些文庫(kù)進(jìn)行基因表達(dá)譜的比較。比較發(fā)現(xiàn),與其他文庫(kù)相比,人類內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒(HERV)、突觸相關(guān)蛋白、發(fā)動(dòng)機(jī)蛋白和信號(hào)傳導(dǎo)蛋白等的表達(dá)在SARS冠狀病毒感染的文庫(kù)中較為活躍。
5、r> 分析結(jié)果提示,在SARS病人生命最后階段的肺部組織中,SARS冠狀病毒的RNA在轉(zhuǎn)錄本中大量存在,伴隨著好幾種類型的并發(fā)感染,同時(shí),SARS冠狀病毒可能依然活躍地在細(xì)胞間傳播。
分析結(jié)果提供了更進(jìn)一步研究SARS病理學(xué)的基礎(chǔ),提升了當(dāng)前對(duì)于宿主感染SARS冠狀病毒后的反應(yīng)在轉(zhuǎn)錄水平上的認(rèn)識(shí)。另外,這些數(shù)據(jù)對(duì)于人類基因組轉(zhuǎn)錄本,特別是對(duì)poly A-RNA轉(zhuǎn)錄本是一個(gè)有用的補(bǔ)充。
SARS冠狀病毒感
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫(kù)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 草魚腸道組織cDNA文庫(kù)構(gòu)建及部分ESTs分析.pdf
- Riboswitch cDNA文庫(kù)合成及分析.pdf
- 東亞飛蝗免疫組織和中樞神經(jīng)組織cDNA文庫(kù)的構(gòu)建與分析.pdf
- 煙草打頂前后根尖組織SSH-cDNA文庫(kù)的構(gòu)建與分析.pdf
- 《sars病人的護(hù)理》
- 人胎盤組織cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及人生長(zhǎng)激素cDNA的克隆.pdf
- 建立cdna文庫(kù)時(shí)cdna的合成條件
- 絨毛組織cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及血清學(xué)篩選.pdf
- 小麥全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)構(gòu)建、測(cè)序與分析.pdf
- 梨果實(shí)cDNA文庫(kù)的構(gòu)建.pdf
- 蘋果果實(shí)cDNA文庫(kù)的構(gòu)建.pdf
- 玉米葉片cDNA文庫(kù)的構(gòu)建.pdf
- 福建柏葉片cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及EST分析.pdf
- 蠕形螨cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及初步分析.pdf
- SARS病人組織中SARS冠狀病毒全基因組克隆、序列分析及病毒樣顆粒裝配.pdf
- 海參肌肉組織全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及初步鑒定.pdf
- 大青楊頂芽cDNA文庫(kù)構(gòu)建及ESTs分析.pdf
- 草魚腸道組織消減cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及免疫相關(guān)基因的克隆與表達(dá)分析.pdf
- 甘薯莖線蟲誘導(dǎo)cDNA文庫(kù)的構(gòu)建與ESTs分析.pdf
- 無(wú)患子葉片cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及EST分析.pdf
評(píng)論
0/150
提交評(píng)論