不同年齡段神農(nóng)架金絲猴腸道菌群組成和差異的研究.pdf

1、金絲猴作為國家一級珍稀保護(hù)動物，數(shù)量稀少，有極高的科研價值，現(xiàn)已被列為瀕危物種。神農(nóng)架金絲猴是金絲猴的一種，屬于川金絲猴。我國政府已采取多種措施保護(hù)神農(nóng)架金絲猴，人工補食計劃是其中之一。人工補食計劃的實施改變了神農(nóng)架金絲猴原有的生活環(huán)境和飲食結(jié)構(gòu)，必然會導(dǎo)致神農(nóng)架金絲猴腸道菌群發(fā)生變化，由于腸道菌群與腸道健康密切相關(guān)，腸道菌群的失調(diào)有可能導(dǎo)致腸道疾病和其它非腸道疾病。因此，研究不同年齡階段神農(nóng)架金絲猴的腸道菌群組成，對監(jiān)測金絲猴的腸道疾

2、病和今后開展金絲猴專用人工飼料對腸道菌群的影響具有重要理論和實際指導(dǎo)意義。
　　本研究共采集神衣架金絲猴糞便樣品47份。其中17份隨機(jī)采集的樣品用于變性梯度凝膠電泳技術(shù)分析，探索神農(nóng)架金絲猴腸道菌群組成和多樣性信息;另外30份樣品來自三個不同年齡段的30只神農(nóng)架金絲猴，用于16S rDNA的V4區(qū)高通量測序分析，得到三個年齡段神農(nóng)架金絲猴腸道菌群組成和差異的信息，并將測得結(jié)果與其他物種的腸道菌群進(jìn)行了比較分析。取得了如下結(jié)果:

3、r>　　1.17份隨機(jī)采集樣品的變性梯度凝膠電泳分析結(jié)果表明:不同個體之間腸道菌群的多樣性存在差異;主要優(yōu)勢菌門及比例:厚壁菌門(Firmicutes，55.6％)和擬桿菌門(Bacteroidetes,13.9％)。
　　2.30份不同年齡段糞樣高通量測序分析結(jié)果表明:神農(nóng)架金絲猴腸道主要優(yōu)勢菌門為厚壁菌門(Firmicutes，20.96％-30.29％)和擬桿菌門(Bacteroidetes，29.85％-39.46％);0

4、-3歲組(Y1)，5-8歲組(Y2)，12歲以上組(Y3)腸道菌群含OTUs的數(shù)目依次為1469，1381，1931;菌門數(shù)目依次為16，16，19;屬的數(shù)目依次為166，157，190;從不同年齡段腸道菌群OUTs數(shù)目比較可以看出:12歲以上組腸道菌群所含種類最多，腸道菌群最為豐富;UPGMA聚類分析表明0-3歲組(Y1)和5-8歲組(Y2)腸道菌群組成較為接近。
　　3.神農(nóng)架金絲猴腸道菌群與其他物種的比較分析結(jié)果顯示，厚壁菌

5、門和擬桿菌門是神農(nóng)架金絲猴腸道和人、非人靈長類腸道共同的優(yōu)勢菌門，但在兩者在3個物種腸道內(nèi)所含的比例有差異(其中金絲猴為:57.88％-62.17％;人為:90％以上;非人靈長類70.50％-98.30);變形菌門在神農(nóng)架金絲猴和人腸道中所占比例有較大的差異;螺旋體門是神農(nóng)架金絲猴腸道的優(yōu)勢菌門，在人、非人靈長類腸道中為非優(yōu)勢菌門;神農(nóng)架金絲猴腸道厚壁菌門以梭菌綱為主，且含有反芻動物特有的纖維桿菌門;神農(nóng)架金絲猴的腸道中存在反芻動物特有