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文檔簡介
1、DGAT1基因和ob基因是與動物脂肪沉積有關(guān)的兩個重要基因。本試驗對豬DGAT1和ob基因進(jìn)行SNP掃描和多態(tài)性分析,以期在這兩個基因上找到與豬背膘厚有關(guān)的分子標(biāo)記,為優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)瘦肉型豬選育提供一條分子育種途徑。 豬DGAT1研究方面,本研究對萊蕪豬DGAT1外顯子6至外顯子8共476bp的序列進(jìn)行了克隆、測序(GenBank收錄號:DQ289596),在外顯子6和8上檢測到兩處SNPs,DGAT1內(nèi)含子6和內(nèi)含子7上有保守的G
2、T-AG拼接識別序列;在萊蕪豬和西方豬種外顯子6至8未發(fā)現(xiàn)類似牛K232A的錯義突變;針對大白豬和萊蕪豬外顯子8上的SNP進(jìn)行PCR-SSCP檢測,發(fā)現(xiàn)萊蕪豬群體處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05),大白豬群體均為CC純合體;克隆了豬DGAT15'調(diào)控區(qū)的部分序列(737bp),在-241bp(相對于起始密碼子ATG)發(fā)現(xiàn)一處由單個腺嘌呤(A)缺失產(chǎn)生的新SNP位點(定義為等位基因Del(A))(GenBank收錄號
3、:DQ463321-22);對大白豬、大萊二元雜交母豬、杜洛克豬和萊蕪豬進(jìn)行了PCR-SSCP檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)萊蕪豬群體Del(A)等位基因頻率最高,所檢測的30頭個體均為Del(A)/Del(A)純合型,所檢測的四個群體均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05);大萊二元雜交母豬群體不同基因型的豬背膘厚差異不顯著(P>0.05),在仔豬初生重方面,Del(A)/Del(A)個體與+/Del(A)個體差異顯著(P<0.05
4、),該位點對初生重的加性效應(yīng)為0.09868kg,顯性效應(yīng)為0.04574kg。 在ob基因的研究方面,本研究在ob基因5'調(diào)控區(qū)-2835位點找到一個新的SNP多態(tài)(G2835A)。對萊蕪豬、大白豬、商品雜交豬、杜洛克豬和大萊二元雜交母豬進(jìn)行了該位點的多態(tài)性檢測,其中萊蕪豬群體中G等位基因頻率最低(0.32),杜洛克豬群體G等位基因頻率最高(0.93);萊蕪豬、大白豬、杜洛克豬和商品雜交豬群體處于Hardy-Weinberg平
5、衡狀態(tài)(P>0.05);大萊二元雜交母豬群體偏離Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P<0.01);對該位點不同基因型背膘厚之間進(jìn)行最小二乘分析,結(jié)果顯示,不同基因型個體的背膘厚差異不顯著(P>0.05)。 本研究分別在豬DGAT1基因和ob基因上找到了3個和1個單核苷酸多態(tài)性標(biāo)記(SNP),對位于5'調(diào)控區(qū)的SNP標(biāo)記與豬背膘厚的關(guān)系進(jìn)行了初步分析。研究結(jié)果為進(jìn)一步探討豬背膘厚形成的分子機制提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。5'調(diào)控區(qū)的SNP
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