額爾齊斯河貝加爾雅羅魚微衛(wèi)星標記篩選及其遺傳多樣性分析.pdf

1、本研究以額爾齊斯河貝加爾雅羅魚（Leuciscus leuciscus baicalensis）為實驗對象，聯(lián)合二代測序技術(shù)和熒光毛細管電泳技術(shù)，開發(fā)微衛(wèi)星位點30個，其中19個來自基因組，11個來自轉(zhuǎn)錄組;利用這30個位點對哈巴河、布爾津及北灣三個群體進行遺傳多樣性分析，并探究這些位點在其他9種鯉科魚類中的通用性。主要結(jié)果如下:
　　1.共合成160對引物，64對來自基因組，96對來自轉(zhuǎn)錄組;在擴增（以北灣群體樣品為模板）過程中

2、出現(xiàn)不同程度的擴增失敗:3對基因組微衛(wèi)星引物和25對轉(zhuǎn)錄組微衛(wèi)星引物未擴增出任何條帶或者未得到目的條帶。
　　2.用30個微衛(wèi)星標記評估北灣、布爾津和哈巴河三個群體的遺傳多樣性，共檢測出等位基因339個，各位點等位基因數(shù)范圍在4-27之間，平均11.3個;有效等位基因數(shù)一共154.28個，介于1.56-15.34之間，平均5.14個;觀測雜合度在0.37-1.00之間，平均值是0.68;期望雜合度在0.36-0.94，平均值是0.

3、75;多態(tài)性信息含量在0.31-0.93之間，平均值是0.71。
　　3.遺傳分化指數(shù)和遺傳距離顯示，三個群體沒有發(fā)生顯著分化;分子方差分析結(jié)果顯示，大部分變異來自個體間，極少數(shù)變異來自種群間。
　　4.位點多態(tài)性比例:基因組31.1％，轉(zhuǎn)錄組15.5％;用于遺傳多樣性評估的指數(shù)，基因組微衛(wèi)星位點的指數(shù)均大于轉(zhuǎn)錄組SSR微衛(wèi)星的指數(shù)。
　　5.30個位點在擬鯉中的通用率最高，為80％，其次是高體雅羅魚，為76.7％;轉(zhuǎn)