貝葉斯廣義線性混合模型及其醫(yī)學(xué)應(yīng)用.pdf_第1頁(yè)
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1、對(duì)同一觀察對(duì)象某研究指標(biāo)在不同時(shí)間或空間上進(jìn)行的多次觀察或測(cè)量的重復(fù)測(cè)量資料(Repeated Measurement Data)是醫(yī)學(xué)研究中常見(jiàn)的形式,它以節(jié)省樣本含量、資料容易收集、檢驗(yàn)效能高等優(yōu)點(diǎn)受到醫(yī)學(xué)界科研人員的青睞。但由于同一個(gè)體不同時(shí)間測(cè)量值之間存在相關(guān)性,給統(tǒng)計(jì)分析方法提出了許多新問(wèn)題,當(dāng)反應(yīng)變量服從正態(tài)分布,常采用線性混合效應(yīng)模型(Linear Mixed Models),其理論完善,方法相對(duì)成熟;當(dāng)結(jié)局變量表現(xiàn)為分類

2、特征,如藥物臨床試驗(yàn)的療效分為有效和無(wú)效,或某月內(nèi)高血壓患者社區(qū)門(mén)診就診次數(shù)等計(jì)數(shù)數(shù)據(jù)等,可采用廣義線性混合模型(Generalized Linear Mixed Models,GLMMs),線性混合效應(yīng)模型也可看作GLMMs的一種特殊情況。 由于GLMMs的似然函數(shù)包含了N個(gè)對(duì)q維隨機(jī)效應(yīng)的積分,只有在一些特殊情況,如應(yīng)變量為連續(xù)變量的正態(tài)恒等式函數(shù)連接,才能直接算出,而更多的情況下,高維積分沒(méi)有解析表達(dá)式,需要采用數(shù)值近似方

3、法。目前常用的GLMMs參數(shù)估計(jì)方法為懲罰偽似然估計(jì)(Penalized Quasi-Likelihood,PQL)和邊際偽似然估計(jì)(Marginal Quasi-Likelihood,MQL)。但這兩種參數(shù)估計(jì)方法在實(shí)際應(yīng)用中暴露出一些不足:MQL方法計(jì)算速度雖快,但只考慮了固定效應(yīng),當(dāng)高水平單位方差較大且其低水平單位數(shù)較小的時(shí)候,該法趨向于低估固定參數(shù)和隨機(jī)參數(shù)的值;PQL方法雖能同時(shí)利用水平2單位的殘差,計(jì)算具有較小的偏性,但其算

4、法不夠穩(wěn)定,在某些情況下有時(shí)不容易收斂,且水平2變異的估計(jì)值卻可能是有偏的。 為解決GLMMs參數(shù)估計(jì)問(wèn)題,本文采用不同于經(jīng)典頻率統(tǒng)計(jì)的貝葉斯方法,先驗(yàn)信息+樣本信息得到參數(shù)的聯(lián)合后驗(yàn)分布,考慮到了方差成分的不確定性,將隨機(jī)效應(yīng)和固定效應(yīng)參數(shù)均看作隨機(jī)變量,應(yīng)用馬爾可夫蒙特卡羅(Markov Chain Monte Carlo,MCMC)方法從后驗(yàn)分布進(jìn)行抽樣,計(jì)算感興趣的參數(shù)估計(jì)。 論文第一章系統(tǒng)闡述了GLMMs的PQ

5、L法和貝葉斯推斷方法的基本原理。第二章針對(duì)不同高水平單位數(shù),低水平數(shù)較小且不平衡的GLMMs數(shù)據(jù),進(jìn)行模擬研究,研究表明:無(wú)論水平2單位數(shù)的大小,貝葉斯方法隨機(jī)效應(yīng)殘差方差估計(jì)值遠(yuǎn)比PQL法更接近真實(shí)值,PQL法嚴(yán)重偏離了真實(shí)值;而對(duì)固定效應(yīng)參數(shù)估計(jì)值,當(dāng)水平2單位數(shù)為20時(shí),貝葉斯法各參數(shù)的均數(shù)和中位數(shù)均要較PQL法更接近真實(shí)值,而隨著水平2單位數(shù)的增加,兩種方法在估計(jì)固定效應(yīng)參數(shù)時(shí)相差并不大,因而,在實(shí)際應(yīng)用中,推薦采用貝葉斯法。第

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