擬南芥基因倍增過程的分析和建模.pdf

1、上世紀(jì)七十年代Ohno提出的基因倍增理論認(rèn)為基因在功能多樣化之前，必需先發(fā)生基因倍增，基因倍增在生物進(jìn)化過程中的重要性甚至超過突變與自然選擇。基因倍增指含有基因的DNA片斷(一段序列、整條染色體甚至整個基因組)在基因組中增加一個或多個拷貝的過程。絕大多數(shù)倍增基因很快假基因化失活，少數(shù)通過突變產(chǎn)生功能分歧，是基因組生成新的功能基因、進(jìn)化出新物種的主要機(jī)制?；虮对鲇袃煞N模式：連續(xù)基因倍增和大規(guī)模基因倍增，兩種基因倍增過程均產(chǎn)生大量基因家族

2、。 在2R模型的基礎(chǔ)上，提出了mR+C模型描述脊椎動物的基因倍增過程，即m次的大規(guī)?；虮对黾由线B續(xù)基因倍增。但是基因倍增的過程具有較高的復(fù)雜性，如此簡單的模型并不能全面反映基因倍增過程。為了清楚的認(rèn)識植物基因倍增過程，本文采用新的數(shù)據(jù)和方法研究擬南芥基因組的基因倍增過程，通過分析連續(xù)基因倍增和大規(guī)?；虮对龅拇嬖诒壤屯x置換率分布，并估計大規(guī)模倍增后基因丟失情況，揭示擬南芥基因倍增特征；并基于尋找到的大規(guī)模基因倍增片段，構(gòu)建