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1、ThemolecularepidemiologyofBVDVinpartsofChinaandthewholegenomesequencingofaBVDVstrainThesissubmittedtoQingdaoAgriculturalUniversityInFulfillmentoftheRequirementfortheDegreeofMasterofAgronomy(CollegeofAnimalScienceandTechn
2、ology)Supervisor：LiuWenhuaAssociateProfessorQingdaoJuneChina2014青島農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要我國部分地區(qū)BVDV的分子流行病學(xué)調(diào)查和一株BVDV的全基因測序摘要牛病毒性腹瀉／黏膜病毒(Bovineviraldiarrheavirusmucosaldiseasevirus，BVDV／MDV)屬黃病毒科(Flaviviridae)瘟病毒屬(Pestivirus)，為單股正鏈RN
3、A病毒，基因組全長約12～13kb，能侵害牛、豬、鹿、牦牛等動物，引起腹瀉、白細胞減少、黏膜糜爛潰瘍、繁殖障礙等臨床癥狀。本試驗共分為三部分，第一部分是我國部分地區(qū)BVDV分子流行病學(xué)調(diào)查與分析。從山西、山東、河南、北京、天津、甘肅等地奶牛場采樣，檢測BVDV，擴增BVDV陽性樣g5’UTR序列制作進化樹，進行遺傳進化分析，確定我國這些地區(qū)奶牛場BVDV的流行的基因型和亞型，分析我國這些地區(qū)BVDV的流行情況，為BVDV的研究提供依據(jù)。
4、第二部分是一株BVDV的全基因測序分析。從天津某奶牛場分離到一株BVDV，該分離株與GenBnk上公布的豬源ZM95株同源性最高。我們利用IUPCR分段擴增、測序和拼接的方法，得到該病毒全基因序列。其全基因分析得出：基因組全長12199bp，其中57一UTR長為330bp，ORF長為11697bp，3UTR為181bp。第三部分是兩個奶牛場BVDV持續(xù)性感染牛(PI)凈化的第二輪凈化檢測，是繼去年對山西和河南某奶牛場進行第一輪檢測、淘汰
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