通過整合組學(xué)研究發(fā)現(xiàn)與肝癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)的長非編碼RNA.pdf_第1頁
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1、軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院博上學(xué)位論義目錄縮略詞表1摘要2Abstract!；前言8第一部分肝癌組織的編碼基因和lncRNA表達(dá)譜研究一lO11材料與方法lO111HCC組織樣本的收集與表達(dá)譜實驗10112表達(dá)譜數(shù)據(jù)的預(yù)處理10113表達(dá)譜數(shù)據(jù)與肝癌樣本的質(zhì)量控制1011t4差異表達(dá)基因和IncRNA的檢測12115富集分析1212結(jié)果13121表達(dá)譜數(shù)據(jù)與樣本的質(zhì)量控制13122差異表達(dá)基因的檢出18123差異表達(dá)lncRNA的檢出19124差異

2、表達(dá)基因的GO富集分析21125差異表達(dá)基因的通路富集分析25126GSEA富集分析一2613討論30第二部分IncRNA功能模塊的發(fā)現(xiàn)3221方法與材料32211lncRNA功能模塊的發(fā)現(xiàn)32212采用CSF算法預(yù)測IncRNA的蛋白質(zhì)編碼能力33213模塊通路富集分析37214差異共表達(dá)模式的檢驗37215ChIPSeq數(shù)據(jù)的分析3722結(jié)果38221lncRNA功能模塊的發(fā)現(xiàn)38222長非編碼RNA彳乩^『c』甜她的發(fā)現(xiàn)4123討

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