采用基因芯片研究表觀遺傳修飾在胃癌發(fā)生機制中的作用.pdf

1、目的:研究表觀遺傳修飾在胃癌發(fā)病機制中的作用。
　　 方法:收集我科2007.10～2008.01病理確診的8例胃癌患者腫瘤組織和正常胃粘膜組織，采用染色質免疫共沉淀聯(lián)合芯片技術（ChIP-chip）在細胞全基因組范圍內對兩種組織細胞內組蛋白H3K27位點三甲基化水平進行高通量的檢測，用染色質免疫共沉淀-實時定量聚合酶鏈反應（ChIP-qPCR）驗證芯片檢測結果，采用熒光定量反轉錄聚合酶鏈反應（qRT-PCR）檢測兩種組織細胞H

2、3K27me3水平存在顯著差異的目的基因mRNA表達水平，最后用甲基化DNA免疫沉淀-定量PCR（MeDIP-qPCR）方法檢測目的基因啟動子區(qū)域DNA甲基化水平。
　　 結果:和正常胃粘膜組織細胞相比較，胃癌腫瘤細胞全基因組范圍共篩選出227個基因組蛋白H3K27me3水平存在顯著差異，其中有67個基因顯示組蛋白H3K27三甲基化水平增高，160個基因組蛋白H3K27三甲基化水平降低；ChIP-qPCR技術檢測兩種組織細胞挑選

3、基因組蛋白H3K27三甲基化水平的差異與CpG島芯片檢測結果一致，兩種組織細胞挑選基因的mRNA表達水平和DNA甲基化水平均存在顯著差異。
　　 結論:與正常胃粘膜細胞相比，胃癌腫瘤細胞多個基因組蛋白H3K27三甲基化水平存在顯著改變；基因組蛋白H3K27三甲基化對調控基因表達發(fā)揮沉默效應；挑選基因DNA甲基化水平亦存在明顯變化，挑選基因DNA甲基化和組蛋白H3K27me3兩種表觀修飾方式存在相互作用，DNA甲基化修飾作用可能存