四向重組自交系群體遺傳圖譜構(gòu)建方法及其在大豆上的應(yīng)用.pdf

1、相對(duì)于兩個(gè)親本之間雜交構(gòu)建的遺傳群體，遺傳信息差異小，多態(tài)性信息含量低，而四交群體含有4個(gè)等位基因，有較高多態(tài)信息含量及豐富的遺傳變異性，利于檢測(cè)到更多的QTL，且標(biāo)記圖譜相對(duì)密集。本研究針對(duì)四向重組自交系群體，通過位點(diǎn)的分離檢驗(yàn)、兩位點(diǎn)間重組率估計(jì)、連鎖群的劃分、位點(diǎn)的排序等步驟提出四向重組自交系遺傳圖譜構(gòu)建方法。通過模擬研究探討不同類型標(biāo)記間連鎖檢測(cè)的功效和重組率估計(jì)的準(zhǔn)確度與精確度、遺傳群體樣本容量等問題。作為實(shí)例研究，應(yīng)用該方法

2、分析了一個(gè)四向重組自交系群體（墾豐14×墾豐15//黑農(nóng)48×墾豐19）的SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)，構(gòu)建大豆的遺傳連鎖圖，探討四向重組自交系群體構(gòu)建遺傳圖譜的可行性。
　　主要研究結(jié)果如下:
　　(1)在不同真實(shí)重組率的LOD值比較可以看出，真實(shí)重組率越小，檢驗(yàn)連鎖的LOD值越高，說明重組率越小，又有利于連鎖的檢測(cè)。雖然各種標(biāo)記組合類型的LOD值隨著重組率和群體大小的變化呈現(xiàn)相似的趨勢(shì)，但是不同標(biāo)記組合類型之間存在較大差異。

3、>　　(2)在不同等位基因的交配中，四個(gè)等位基因比三個(gè)等位基因、兩個(gè)等位基因更容易檢測(cè)到兩個(gè)位點(diǎn)的連鎖。
　　(3)用四向重組自交系群體構(gòu)建遺傳圖譜，群體大小在100個(gè)以上，可以滿足重組率小于0.3時(shí)（遺傳距離約30cM）的連鎖檢測(cè)。
　　(4)構(gòu)建了一張含有187個(gè)SSR不同的標(biāo)記，該些標(biāo)記主要分布在21個(gè)大豆的遺傳圖譜中，而這21個(gè)遺傳圖譜構(gòu)成一個(gè)連鎖圖譜群。這張圖譜所擁有的基因組的長度在4010.25cM左右，標(biāo)記與標(biāo)