雙峰駝免疫球蛋白重鏈基因的系統(tǒng)分析.pdf

1、抗體由兩條分子量較大的重鏈和兩條分子量較小的輕鏈組成，輕鏈和重鏈以及重鏈之間由二硫鍵相連。但是，在駱駝科內(nèi)發(fā)現(xiàn)了一種缺失輕鏈和重鏈恒定區(qū)第一個結(jié)構(gòu)域（CH1）的抗體，稱為重鏈抗體（Heavy chain only antibodies，HCAbs)。通過其RNA信息和基因組序列，我們對雙峰駝免疫球蛋白重鏈基因進(jìn)行了系統(tǒng)分析。
　　利用5' RACE，我們從雙峰駝脾臟RNA中得到了三種免疫球蛋白重鏈基因可變區(qū)的特異性cNDA文庫，利

2、用3′RACE，我們建立了免疫球蛋白重鏈CH基因特異的cDNA文庫用于分析其免疫球蛋白的基因類型。我們獲得了來自于γ3、γ1a/b和μ基因的可變區(qū)序列以及發(fā)現(xiàn)了一種μ基因、五種γ基因、一種α基因和一種ε基因。另外，我們從基因組測序數(shù)據(jù)中搜索到了7種DH、6種JH基因和μ、γ2a、γ2c、α、ε基因，以及γ3基因的鉸鏈區(qū)。
　　分析重鏈可變區(qū)序列發(fā)現(xiàn) Kozak序列家族相關(guān)性很高，系統(tǒng)發(fā)育分析雙峰駝 VH3家族以及VH4家族與單峰駝

3、對應(yīng)家族的親緣關(guān)系最為接近。比較VHH和VH家族成員的多樣性指數(shù)發(fā)現(xiàn)VHH存在一個額外的高變區(qū),并且其CDR3的平均長度大于VH。統(tǒng)計(jì)影響可變區(qū)空間結(jié)構(gòu)的關(guān)鍵位置氨基酸使用情況發(fā)現(xiàn),VHH與VH存在明顯不同。利用基因組序列，我們繪制了部分免疫球蛋白基因座位點(diǎn)的圖譜。系統(tǒng)發(fā)育分析重鏈恒定區(qū)發(fā)現(xiàn)其與單峰駝親緣關(guān)系最近，但是雙峰駝γ3基因的鉸鏈區(qū)與單峰駝對應(yīng)的γ3基因的鉸鏈區(qū)相比存在兩個氨基酸的差異，利用PAML分析發(fā)現(xiàn)這兩個氨基酸屬于正選擇