鵝脂肪性狀候選基因的研究.pdf

1、本試驗用PCR-SSCP方法對四川白鵝、溆浦鵝和洞庭草鵝研究了與脂肪性狀可能相關(guān)的OBR和PPAR等基因，檢測了基因的SNP，序列提交到GenBank。分析了品種內(nèi)和品種間的基因、基因型分布、遺傳多態(tài)性以及與其它動物的同源性。在對不同品種鵝進行脂肪性狀測定基礎(chǔ)上，分析了OBR基因和PPAR基因的SNPs基因型對鵝脂肪性狀的影響及其遺傳效應(yīng)，篩選出優(yōu)勢基因型。采用δ差異顯示法篩選出與鵝脂肪沉積性狀顯著相關(guān)的陽性EST，進行了克隆測序和同源

2、性比對分析，找出了高度同源性的相關(guān)基因。所獲陽性：EST序列提交GenbBank數(shù)據(jù)庫。結(jié)果表明： 1. OBR基因在溆浦鵝和四川白鵝的DNA片段中都存在3種不同基因型，該基因片段序列的56bp處有一個A→G的突變，該序列已登錄GenBank(登錄號為：DQ346681)；該堿基突變導(dǎo)致氨基酸序列變異。本研究中的鵝OBR基因片段序列與火雞和部分雞的OBR基因序列同源性達100％，與人、猿、豬、馬、犬等哺乳類單胃動物的同源性都達到

3、96％。不同品種中OBR基因型頻率和基因頻率存在顯著差異。 2. OBR基因的SNP基因型對本研究的鵝腹脂重、腹脂率和血漿VLDL濃度都有極顯著或顯著的影響，但在兩品種間存在明顯差異。BB型是降低鵝腹脂重、腹脂率和血漿VLDL濃度的優(yōu)勢基因型，其貢獻率對溆浦鵝超過29％，對四川白鵝超過20％。AA型是提高溆浦鵝腹脂重、腹脂率和血液VLDL濃度的優(yōu)勢基因型，其貢獻率超過8％。OBR基因?qū)︿悠柱Z腹脂重的主效應(yīng)指數(shù)(MEI)達到44.

4、466，對血漿VLDL濃度為21.284，對腹脂率為16.797；OBR基因?qū)λ拇ò座Z腹脂重的MEI達到9.638，對血漿VLDL濃度為21.112，對腹脂率為8.442，對皮脂厚為10.685。推測OBR基因可作為鵝脂肪性狀的主效應(yīng)基因。 3. PPAR α基因在洞庭草鵝中存在單核苷酸突變，但氨基酸序列不變。該序列與番鴨、家鴨、鼠等動物有95％以上同源性。SNP基因型對該鵝腹脂重、腹脂率有顯著影響，其中AA型和BB型腹脂重顯著

5、低于AB型，BB型腹脂率顯著低于AB型。BB型是降低鵝腹脂重、腹脂率的優(yōu)勢基因型，其貢獻率超過8％，而AB型對腹脂率產(chǎn)生5.263％的正向貢獻率。PPAR α僅基因?qū)Ω怪氐腗EI為12.11，對腹脂率為17.31。推測PPARα基因可作為鵝脂肪性狀的主效應(yīng)基因或與控制腹脂性狀的主基因連鎖。 4. 采用δ差異顯示法，發(fā)現(xiàn)在鵝的不同組織特異性表達的陽性11條片斷，經(jīng)克隆測序后均遞交到GenBank，登錄號為：EY199060～EY