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文檔簡介
1、目的:為準確診斷和評估包蟲病流行區(qū)犬科動物細粒棘球絳蟲感染情況,建立一種快速檢測細粒棘球絳蟲感染犬糞蟲體 DNA的檢測方法—環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)(loop-mediated isothermal amplification. LAMP)。
方法:1)針對細粒棘球絳蟲線粒體DNA CO1和ND2基因設(shè)計2套LAMP引物;分別用兩套引物進行LAMP法與普通 PCR方法的特異性比較,檢測細粒棘球絳蟲、多房棘球絳蟲、犬腸道內(nèi)常見其它寄生
2、蟲(包括犬弓首蛔蟲和泡狀帶絳蟲)以及肥胖帶絳蟲DNA;將含有目的基因片段的質(zhì)粒作為標準陽性對照,并做10倍梯度稀釋進行LAMP法和PCR法敏感性的比較。2)將采集的46份犬糞便標本(采集自四川石渠和巴音布魯克草原細粒棘球絳蟲流行區(qū)以及新疆醫(yī)科大學(xué)動物實驗中心)提取DNA,分別運用LAMP、PCR和犬尸體剖檢進行3種方法感染犬的初步檢測評估。3)運用針對CO1基因設(shè)計的LAMP引物對8只人工感染犬進行窗口期的初步確定,并與PCR法進行比較
3、。
結(jié)果:1)成功設(shè)計兩套LAMP引物,E.gmtDNA CO1基因的引物,以棘球絳蟲DNA(包括細粒棘球絳蟲絳蟲和多房棘球絳蟲)為模板的反應(yīng)體系出現(xiàn) LAMP陽性結(jié)果,與犬腸道其它寄生蟲和肥胖帶絳蟲為模板的反應(yīng)體系沒有出現(xiàn) LAMP陰性結(jié)果,且該引物的敏感性比普通PCR高出10倍。E.gmtDNA ND2基因的引物能夠鑒別多房棘球絳蟲,并不與其他檢測的寄生蟲發(fā)生交叉反應(yīng),且最低檢測限度為4×101拷貝(靈敏度比普通PCR高出
4、103倍)。2)在初步對46份犬糞便DNA檢測結(jié)果中 ND2引物顯示出較好的靈敏度和特異度,χ2檢驗,該方法與犬尸體剖檢/PCR方法的診斷效果無統(tǒng)計學(xué)差異。3) CO1 LAMP引物推定8只人工感染犬的窗口期,LAMP法比PCR法提早2d,與PCR法相比,縮短了E.g感染犬的窗口期。
結(jié)論:本研究初步建立了LAMP技術(shù)檢測細粒棘球絳蟲感染犬的新方法,在各項特異度、靈敏度和樣本檢測中展現(xiàn)出較好的研究效果。該方法不需要昂貴的儀器設(shè)
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