彌漫大B細(xì)胞淋巴瘤外周血分子標(biāo)志物的初步探索.pdf

1、中山大學(xué)碩士學(xué)位論文彌漫大B細(xì)胞淋巴瘤外周血分子標(biāo)志物的初步探索姓名：蔡月申請學(xué)位級別：碩士專業(yè)：腫瘤學(xué)指導(dǎo)教師：孫曉非20100520中山大學(xué)碩士學(xué)位論文彌漫大B細(xì)胞淋巴瘤外周血分子標(biāo)志物的初步探索研究目的：本研究的目的在于運(yùn)用微陣列技術(shù)分析I)I_BOL與正常人外周血白細(xì)胞基因的差異表達(dá)，篩選特征基因，建立特征分類預(yù)測模型，以期作為一種輔助診斷、療效評價以及預(yù)測預(yù)后的檢查手段，為將來的新的治療靶點(diǎn)選擇、腫瘤發(fā)生發(fā)展機(jī)制研究提供基礎(chǔ)。

2、二研究材料和方法1研究收集了我院2008年12月至2009年9月初診的68例DLBCL患者的血液樣本及臨床資料：其中男性35例，女性33例，中位年齡52歲(8歲’78歲)；按AnnAbor分期，I期8例，II期30例，III期9例，IV期2l例；1個以上結(jié)外病變48例，結(jié)內(nèi)病變20例；根據(jù)Hans分類原則的亞型分類：6CB組32例(471％)，nonGCB組36例(529％)。抽取同時期門診證實(shí)的59例健康志愿者血液樣本作對照。抽提其總

3、RNA并保存作為研究樣本。2選取28例RNA樣本于上海生物芯片有限公司行Agilent全人類基因表達(dá)譜芯片分析，包括8例DLBCL患者與20例健康志愿者；運(yùn)用Genespring100軟件初步分析芯片的差異表達(dá)基因，并通過DAVID在線軟件簡要分析其相應(yīng)功能，主要包括基因本體論和信號通道兩方面。3運(yùn)用微陣列顯著性分析(SAM)、FScore和支持向量機(jī)(SvM)相結(jié)合的多步驟降維分類法，挑選其中顯著差異的特征基因。4運(yùn)用實(shí)時熒光定量PE

4、R方法驗(yàn)證上述特征基因，利用85例樣本建立腫瘤分類預(yù)測模型，包括45例DLBCL患者與40例健康志愿者；再利用30例樣本作為獨(dú)立驗(yàn)證組，評判該預(yù)測模型的判別能力，包括12個DLBCL患者和18個健康志愿者。三結(jié)果128例芯片初步分析結(jié)果(包括8例DLBCL和20例正常對照)(1)兩組男女比例均l：l，中位年齡，DLBCL組為345歲，正常對照組為365歲；我們在41000個基因中共發(fā)現(xiàn)13815個差異表達(dá)基因，其中DLBCL組較正常對照