RNA二級結構圖形表示法及相似性分析研究.pdf

1、生物序列的表示和比較是生物信息處理的兩個基本問題，也是近年來生物信息學研究的重點。RNA是重要的生命物質，隨著最近非典、禽流感等病毒的出現(xiàn)，作為其主要遺傳物質的RNA也逐漸成為研究的重點之一。 本文以RNA二級結構的分析比較為背景，提出了新的RNA二級結構圖形表示方法，為生物序列的分類、分析、比較和儲存等研究提供了新的途徑。另外，還展示這些表示法在RNA二級結構相似性分析上的具體應用。 通過對現(xiàn)有的RNA圖形表示法的研究

2、分析，在廖波提出的三維表示法的基礎上，擴充了堿基的分類，增加了假結內外自由基的劃分，提出了一種新的RNA二級結構三維圖形表示法－S曲線組表示法。采用矩陣不變量的方法，將S曲線組表示法應用在6種典型的RNA分子片斷的相似性分析上，可以有效的計算出它們之間的相似度。S曲線組表示法包含更豐富的生物學信息，對RNA分子的相似性比較和分析更加準確。 小波分析是近些年來迅速發(fā)展的信號處理方法，本文提出了一種可以將RNA二級結構表示成為波形信