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文檔簡介
1、近幾年,以DNA為模板合成的銀納米簇(DNA-AgNCs)在生物傳感及成像領(lǐng)域吸引了越來越多科學(xué)家的關(guān)注。由于量子產(chǎn)率高、抗光漂白性強(qiáng)及細(xì)胞毒性低等優(yōu)點(diǎn),DNA-AgNCs已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于生物傳感器的設(shè)計(jì)中,在生物標(biāo)記及生物成像中也有較多的應(yīng)用。末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶(TdT)是一種特殊的DNA聚合酶。由于其不需要模板的性質(zhì),TdT在核酸標(biāo)記上已有較多的應(yīng)用。本文基于末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶的擴(kuò)增,開發(fā)出一種新型的DNA-AgNCs合成方法,
2、并將其應(yīng)用于核酸酶的活性檢測及蛋白質(zhì)的分析中。具體如下:
1.利用末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶(TdT)催化擴(kuò)增單鏈DNA的性質(zhì),構(gòu)建了一種新型合成DNA-AgNCs的方法。通過TdT在一條不能夠用作DNA-AgNCs合成模板的DNA的3'-OH端擴(kuò)增出一段富含胞嘧啶(C)的DNA序列,然后利用該擴(kuò)增的富C序列成功地合成出了具有熒光性質(zhì)的DNA-AgNCs。另外,我們考察了會影響TdT擴(kuò)增及DNA-AgNCs合成的幾個因素。我們還把以
3、TdT的擴(kuò)增產(chǎn)物DNA-P-Cn作為模板合成的DNA-AgNCs與幾條人工合成的短鏈富C序列作對比,發(fā)現(xiàn)以DNA-P-Cn為模板的DNA-AgNCs的熒光強(qiáng)度要高很多。接著,利用透射電子顯微鏡(TEM)及其附件X射線能譜分析儀(EDS)來對DNA-AgNCs進(jìn)行表征。結(jié)合TEM的結(jié)果,我們推斷長鏈模板合成的DNA-AgNCs熒光更強(qiáng)的原因是因?yàn)?
1).長鏈序列移除AgNCs表面的極性溶劑,更好地保護(hù)AgNCs;
2
4、).AgNC之間存在熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)現(xiàn)象。
2.基于新型DNA-AgNCs合成方法,我們開發(fā)出了一種末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶(TdT)的活性分析方法。該方法獲得的檢測限(0.0318U)比早前關(guān)于TdT活性檢測的報(bào)道中的低200倍左右,實(shí)現(xiàn)了無標(biāo)記、高靈敏地對TdT酶活進(jìn)行“turn-on”檢測。同時,該方法具有比較穩(wěn)定的重現(xiàn)性,在實(shí)際樣品中的添加回收實(shí)驗(yàn)也取得令人滿意的結(jié)果。最后,我們分析了TdT的幾種常見抑制劑(焦
5、磷酸鈉、金精三羧酸和三磷酸腺苷)的抑制效果。
3.基于TdT對隨機(jī)底物的擴(kuò)增及DNA-AgNCs的合成,我們開發(fā)出一種具有普適性的核酸酶“turn-on”檢測方法。我們選取限制性內(nèi)切酶及3'-5'核酸外切酶的典型代表——EcoRⅠ和ExoⅢ作為目標(biāo)分析物。實(shí)驗(yàn)得出,EcoRⅠ的檢測限為0.0629U,ExoⅢ的檢測限為0.00867U,均比相關(guān)文獻(xiàn)中報(bào)道的要低。此外,對兩種酶檢測的信背比(S/B)分別為30.3及103.2。因
6、此該方法具有很高的靈敏度。由于核酸酶對底物的特異性而具有很好的選擇性。此外,該方法只需要對DNA底物稍作改動,就可以應(yīng)用于切刻酶、DNA連接酶、甲基化酶及堿性磷酸酶等DNA相關(guān)酶類的活性分析中。
4.基于凝血酶的核酸適體及切刻酶Nb.BbvCI,我們把新型DNA-AgNCs合成方法應(yīng)用于凝血酶的“turn-on”放大檢測。通過合理地設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)中涉及的兩條DNA探針——一條核酸適體探針及一條擴(kuò)增探針,我們實(shí)現(xiàn)了高靈敏度地檢測痕量凝
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