櫛江珧的群體遺傳結(jié)構(gòu)及厚唇光唇魚微衛(wèi)星位點的研究.pdf

1、集萎夫?qū)W碩士學位論文櫛江珧的群體遺傳結(jié)構(gòu)及厚唇光唇魚微衛(wèi)星位點的研究A n a l y s i s o fg e n e t i c s t r u c t u r e o ft h e c o m b p e ns h e l lA t r i n a p e c t i n a t a a n d d e v e l o p m e n t o f- ● ●●l i b ● ■l i b- - 一l i e ■ - - ● 一 m

2、I C r o S a t e ¨I t e _ o C I I nA C ，o S S o C 力e J ，U SJ a o J a f U S論文答辯日期： 2 Q 蘭2 生魚旦里旦櫛江珧的群體遺傳結(jié)構(gòu)及厚唇光唇魚微衛(wèi)星位點的研究摘 要櫛江珧是一種利用價值高的大型海產(chǎn)經(jīng)濟貝類，近幾十年來，由于對其棲息環(huán)境的破壞及對成貝、幼貝的濫捕，產(chǎn)量急劇下降，一些海區(qū)已難以采集到櫛江珧。本研究采用A F L P 標記技術和核糖體基因2

3、8 Sr D N A 序列分析對櫛江珧群體遺傳多樣性和遺傳分化進行探討，以期為進一步開展櫛江珧種質(zhì)資源評估、資源保護及人工育種提供重要的科學數(shù)據(jù)。l 、采用A F L P 分子標記技術，篩選出1 0 對櫛江珧A F L P 選擇性擴增引物，并對櫛江珧5 個野生群體( 江蘇連云港、福建東山、廣東湛江、廣西北海、海南臨高) 的遺傳結(jié)構(gòu)進行研究。1 0 對選擇性擴增引物在5 個群體中共擴增出9 8 4 個位點。遺傳多樣性結(jié)果顯示，櫛江珧5 個

4、群體的平均每位點等位基因數(shù)彳為1 ．4 7 1 5 ～1 ．7 9 9 8 ，平均為1 ．5 6 3 2 ；平均每位點有效等位基因數(shù)( 彳。) 為1 ．1 9 5 6 ～1 ．4 1 5 l ，平均為1 ．2 7 3 2 ；多態(tài)位點比例( 尸) 為4 7 ．1 5 ％～7 9 ．9 8 ％，平均為5 6 ．3 2 ％；N e i ’S 基因多樣性指數(shù)( 日) 為0 ．1 2 2 7 ～0 ．2 5 0 6 ，平均為0 ．1 6 6 4

5、；S h a n n o n 氏指數(shù)( ，) 為0 ．1 9 3 3 ～0 ．3 8 3 4 ，平均為0 ．2 5 6 4 。其中，福建東山群體的各項遺傳多樣性指標最高，遺傳多樣性最為豐富；海南臨高群體的遺傳多樣性最低。群體間遺傳分化結(jié)果顯示，櫛江珧5 個群體的遺傳距離( D ) 為0 ．0 2 7 6 ～0 ．2 8 2 9 ；遺傳相似度( ，) 為O ．7 5 3 6 ～0 ．9 7 2 8 ；遺傳分化系數(shù)( G s 7 ’) 為O

6、 ．0 7 3 4 ～0 ．4 1 8 2 ，基因流( ‰)為0 ．6 9 5 6 ～6 ．3 1 3 4 ；地理距離為1 3 1 ．0 0 8 ～1 8 8 1 ．7 4 4 k m ?？傮w水平上的分析結(jié)果顯示，總遺傳變異( 島) 為0 ．2 9 1 4 ，群體間的遺傳變異( 礬) 為0 ．1 6 6 5 ，群體間的遺傳分化系數(shù)( G s 7 1 )高達0 ．4 2 8 8 ，基因流( Ⅳ卅) 僅為0 ．6 6 6 2 。通過相關性分

7、析顯示，5 個群體的地理理距離與遺傳距離( D ) 、遺傳分化系數(shù)( G s 7 ’) 之間均存在顯著相關性( P < O ．0 5 ) ，相關系數(shù)分別為0 ．7 3 3 、0 ．6 3 6 。U P G M A 聚類結(jié)果表明，廣東湛江群體和廣西北海群體親緣關系最近，聚為一支，再與海南臨高群體聚為一支，最后與福建東山群體再聚為一支，江蘇連云港群體單獨為一支。2 、核糖體基因2 8 S r D N A 部分序列分析了5 個櫛江珧群體

8、共5 0 個樣本中共發(fā)現(xiàn)了兩種序列差異顯著的單倍型，并分別命名為J Y - 2 8 S 一1 、J Y - 2 8 S 一2 ，序列一致性約為4 0 ％。其中2 6 個樣本屬于單倍型J Y - 2 8 S —l ，其余2 4 個樣本歸類于單倍型J Y - 2 8 S ．2 。通過對序列的變異分析，單倍型J Y - 2 8 S ．1 中，櫛江珧5 個群體的2 6 個樣品中共發(fā)現(xiàn)2 6 個多態(tài)位點，包含7 個堿基插入／缺失位點和1 9 個堿