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文檔簡介
1、本文研究了基于CART(Classification and Regression Tree)算法的基因芯片數(shù)據(jù)的分類問題?;蛐酒夹g對于早期癌癥的診斷和確診是一個革命性工具,它從基因表達的角度判斷發(fā)病情況。而獲得的高維數(shù)據(jù)和少量樣本問題對于分類識別方法提出了很大的挑戰(zhàn)。模式識別問題中,對于高維數(shù)據(jù)來說一般需要進行特征選擇或者特征提取來降低維數(shù),目的是提高分類的效率和分類的識別率。
特征選取的方法很多,本文采取了小波特征
2、提取細節(jié)系數(shù),為了找到基因信息,我們把合適層數(shù)的細節(jié)系數(shù)重構回了原始樣本空間,后使用Wilcoxon秩和檢測選擇一小部分基因表達差異最大的基因。做完特征選取之后,本文以CART決策樹算法作為分類器,采用10-fold交叉驗證方法來劃分訓練樣本和測試樣本,以基尼指數(shù)(Gini's diversity index)作為誤差函數(shù),訓練樣本構建分類器,測試樣本用于分類。最后,以最小代價復雜性進行剪枝找到最優(yōu)規(guī)模的分類樹。
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