基于小波樹的后綴數(shù)組壓縮算法.pdf

1、后綴數(shù)組是一種簡單的、功能強大的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),在全文索引設計、數(shù)據(jù)壓縮算法、生物信息學等領(lǐng)域中都有著廣泛的應用。但是,后綴數(shù)組需要龐大的空間進行存儲,因此研究后綴數(shù)組的壓縮算法有著重大的意義。
　　本文提出基于小波樹的后綴數(shù)組壓縮算法,對后綴數(shù)組的占有空間進行了有效的壓縮。在研究壓縮后綴數(shù)組(CSA)的基礎(chǔ)上,分析CSA的建立過程,對CSA進行了局部優(yōu)化。結(jié)合后綴數(shù)組上的后向搜索算法以及CSA數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)特點,探究后綴數(shù)組的壓縮算法應具備

2、的特性,據(jù)此特性提出問題轉(zhuǎn)化,并驗證了利用小波樹壓縮后綴數(shù)組的可行性。詳細設計了基于小波樹的后綴數(shù)組壓縮算法,降低了后綴數(shù)組所需的存儲空間。在兩種不同樹形的小波樹編碼方式上,分析算法能獲得的壓縮比。進一步提出利用二進制壓縮編碼對小波樹進行壓縮,使算法達到更高的壓縮比。
　　經(jīng)過理論及實驗分析得出,采用Huffma n形的小波樹對后綴數(shù)組進行壓縮編碼,進一步采用Run-Length?編碼對小波樹進壓縮,能夠在合理的時間內(nèi)完成后綴數(shù)組