2023年全國碩士研究生考試考研英語一試題真題(含答案詳解+作文范文)_第1頁
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文檔簡介

1、生物信息學(xué)是利用數(shù)學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、信息學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)來研究生物學(xué)的問題的學(xué)科。它研究的一個(gè)重要準(zhǔn)則是,結(jié)構(gòu)決定功能。類似結(jié)構(gòu)往往有類似的功能。當(dāng)前已知結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)數(shù)目遠(yuǎn)遠(yuǎn)少于序列蛋白質(zhì)的數(shù)量,且已知結(jié)構(gòu)和功能的蛋白質(zhì)則更少。因而通過計(jì)算的方法,確定類似結(jié)構(gòu),推至功能是生物學(xué)信息學(xué)研究的重要內(nèi)容。
  TM-align是一個(gè)有效的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)比較工具,通過對其旋轉(zhuǎn)和平移,找到最大的重合的部分的TM-score分?jǐn)?shù)。算法涉及大量的TM-sc

2、ore計(jì)算。CUDA技術(shù)是一種統(tǒng)一的高并發(fā)的計(jì)算體系結(jié)構(gòu),可以有效的解決TM-score計(jì)算問題。
  研究成果包括:研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)比對算法的傳統(tǒng)的實(shí)現(xiàn)方式,即使用傳統(tǒng)的串行的CPU來進(jìn)行結(jié)構(gòu)比對算法;研究全局使用CUDA加速多個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)比對算法,包括統(tǒng)一的計(jì)算方法和存儲算法分離的方法;研究CUDA和CPU相結(jié)合計(jì)算方法,使得加速一對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)比對成為可能;研究通過CUDA工具包調(diào)試優(yōu)化存儲和算法的方法。
  通過CPU和

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