ChIP-sequencing基因組數(shù)據(jù)可視化平臺(tái)的設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn).pdf

1、隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)在生物學(xué)中的應(yīng)用，生物基因中組學(xué)數(shù)據(jù)的研究成為了生物信息化研究中的一個(gè)熱點(diǎn)。對(duì)于這些復(fù)雜的基因組數(shù)據(jù)，如何快捷地直觀地觀察這些數(shù)據(jù)，并挖掘數(shù)據(jù)間的潛在關(guān)系以及解讀這些數(shù)據(jù)，已經(jīng)成為生物學(xué)家所要面臨的巨大問(wèn)題。目前，通過(guò)一個(gè)基因可視化分析工具，不再停留在數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析的表面，而是可以深入到高通量數(shù)據(jù)應(yīng)用中的細(xì)節(jié)，并在此基礎(chǔ)上進(jìn)行分析，以幫助生物學(xué)家進(jìn)行生物學(xué)上的研究。
　　本文從建立基因組數(shù)據(jù)可視化處理平臺(tái)的需求出發(fā)，設(shè)

2、計(jì)并實(shí)現(xiàn)了一個(gè)ChIP-sequencing基因組數(shù)據(jù)序列可視化處理平臺(tái)，借助于計(jì)算機(jī)系統(tǒng)強(qiáng)大的數(shù)據(jù)讀取、處理、顯示、交互等能力，可以快速對(duì)復(fù)雜的基因數(shù)據(jù)進(jìn)行可視化地顯示與交互。由于一個(gè)ChIP-sequencing基因組數(shù)據(jù)文件有幾百兆，本系統(tǒng)能夠快速讀取加載這些海量數(shù)據(jù)，同時(shí)高實(shí)時(shí)性也是本系統(tǒng)區(qū)別于其他可視化工具的顯著特點(diǎn);系統(tǒng)具有在2D與3D視角下以直方圖的形式顯示生物染色體基因組數(shù)據(jù)，并實(shí)現(xiàn)直方圖的放大、縮小、旋轉(zhuǎn)、平移等功能，