雙線(xiàn)性分析與聯(lián)合假設(shè)檢驗(yàn)在基因分析中的應(yīng)用.pdf

1、microRNA簡(jiǎn)稱(chēng)miRNA，是一類(lèi)長(zhǎng)約22核苷酸(nt)的非編碼的單鏈RNA分子，由約70nt的前體miRNA(pre-miRNA)經(jīng)Dicer酶剪切而來(lái)。miRNA參與生命過(guò)程中一系列的重要進(jìn)程，包括發(fā)育、造血、器官形成、凋亡和細(xì)胞增殖，甚至是癌癥發(fā)生。目前人類(lèi)基因組中已確認(rèn)的miRNA約500個(gè)，其中至少有200多種miRNA序列與癌癥發(fā)生有關(guān)。RNA干擾作為近年來(lái)的重大科學(xué)發(fā)現(xiàn)，如今對(duì)于這種起抑制蛋白合成作用小分子RNA的研究

2、已成為分子生物學(xué)領(lǐng)域的熱門(mén)。從研究利用RNA干擾技術(shù)來(lái)阻滯癌癥等疾病開(kāi)始，越來(lái)越多的線(xiàn)索表明miRNA與癌癥之間存在著密切的關(guān)系。
　　聯(lián)合假設(shè)檢驗(yàn)(Integrative Hypothesis Test，IHT)和雙線(xiàn)性分析(Bilinear Analysis)近來(lái)被提出用于研究假設(shè)檢驗(yàn)，分類(lèi)和特征選擇。雙線(xiàn)性分析基于多元判別分析，將原有的基于向量的判別分析推廣到基于矩陣的判別分析。本文除了將IHT用于識(shí)別miRNA在肺癌和慢性

3、阻塞性肺病Chronic Obstructive Pulmonary Disease（COPD）上的差異表達(dá)之外還提出一種基于bootstrapping的方法來(lái)改進(jìn)IHT給出的來(lái)源于小樣本和缺失值問(wèn)題，并提高基因排名的可靠性。我們?cè)贕EO公開(kāi)肺癌數(shù)據(jù)集GSE24709的實(shí)驗(yàn)中，已經(jīng)被報(bào)道過(guò)的14個(gè)差異表達(dá)miRNA在單個(gè)基因分析的枚舉結(jié)果中重新得到了確認(rèn)。除肺癌數(shù)據(jù)集之外，還利用同時(shí)具有癌和癌旁數(shù)據(jù)集GSE6857肝癌數(shù)據(jù)集對(duì)雙線(xiàn)性分析